Gene Ctet\TeTxLC
| General Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Symbol | Ctet\TeTxLC | Species | C. tetani | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name | Tetanus toxin light chain | Annotation symbol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Feature type | engineered_foreign_gene | FlyBase ID | FBgn0016753 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Model Status | Not Applicable | Stock availability | 10 publicly available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Also Known As | TNT, TeTxLc, TeTx, tetanus toxin | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genomic Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome (arm) | Recombination map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytogenetic map | Sequence location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Automatically generated summary
See sections below for more information | The gene Tetanus toxin light chain is referred to in FlyBase by the symbol Ctet\TeTxLC (FBgn0016753). It is a engineered_foreign_gene from Clostridium tetani. Its molecular function is unknown. The biological processes in which it is involved are not known. 12 alleles are reported. The phenotypes of these alleles are annotated with: nervous system; organ system subdivision; organ system; adult segment; embryonic/larval neuron; adult mesothoracic segment; multi-cell-component structure; peripheral nervous system; serotonergic neuron; indirect flight muscle. It has no annotated transcripts. Gene has not been localized to the genome sequence. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Recent Updates
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| Description |
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| FB2013_03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FB2013_02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Detailed Mapping Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FlyBase Computed Cytological Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cytogenetic map Evidence for location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimentally Determined Cytological Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cytogenetic map Notes References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimentally Determined Recombination Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Left of (cM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Right of (cM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Notes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model & Products | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments on Gene Model | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Annotated Transcripts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name FlyBase ID RefSeq ID Length (nt) Associated CDS
(aa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Transcript Data & Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported size (kB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polypeptide Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Annotated Polypeptides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name FlyBase ID Predicted MW (kDa) Length (aa) Theoretical pI RefSeq ID GenBank protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Polypeptide Data & Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported size (kDa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences Consistent with the Gene Model
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| DDBJ / EMBL / GenBank | DNA sequence Protein
sequence Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/Swiss-Prot | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/TrEMBL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mapped Features | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type Symbol &
Location Additional Notes References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript Expression | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Descriptive Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Marker for | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CV Term | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polypeptide Expression | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Descriptive Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Marker for | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization (GO Cellular Component) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression Deduced from Reporters | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
High-Throughput Expression Data
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| Associated Tools | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference |
See Gelbart and Emmert, 2010.10.13
for analysis details and data files for all genes.
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FlyAtlas Anatomy Microarray
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modENCODE Anatomy RNA-Seq
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modENCODE Development RNA-Seq
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modENCODE Cell Lines RNA-Seq
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modENCODE Treatments RNA-Seq
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Expression Clusters
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External Data & Images
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| Linkouts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alleles & Phenotypes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Allele Phenotypes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lethality Allele Sterility Allele Other Phenotypes Allele Phenotype manifest
in Allele aCC neuron & neuromuscular junction, with Scer\GAL4eve.RRC aCC neuron & synapse, with Scer\GAL4eve.RRC aCC neuron & synapse, with Scer\GAL4sca-537.4 antennal sense organ & neuron, with Scer\GAL4GH86 chemosensory sensory organ & neuron, with Scer\GAL4GH86 giant fibers & synapse, with Scer\GAL4c17 larval maxillary sense organ & neuron, with Scer\GAL4GH86 monopolar laminar cell & axon, with Scer\GAL4MZ1369 pharyngeal sense organ & neuron, with Scer\GAL4GH86 photoreceptor cell R7 & axon, with Scer\GAL4GMR.PF photoreceptor cell R7 & axon, with Scer\GAL4MZ1369 photoreceptor cell R8 & axon, with Scer\GAL4GMR.PF photoreceptor cell R8 & axon, with Scer\GAL4MZ1369 RP2 neuron & synapse, with Scer\GAL4sca-537.4 synapse & aCC neuron, with Scer\GAL4eve.RRK synapse & RP2 neuron, with Scer\GAL4eve.RRK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classical Alleles ( 0 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| For All Classical Alleles Show | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Alleles Carried on Transgenic Constructs
( 12 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| For All Alleles Carried on Transgenic Constructs Show | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Aneuploid Aberrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transgenic Constructs & Insertions
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| Transgenic Constructs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of
construct Name Expression
data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Insertions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of insertions Name Expression
data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology: Function, Process
& Cellular Component ( 0 unique terms ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Terms Based on
Experimental Evidence ( 0 terms ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Terms Based on Predictions or
Assertions ( 0 terms ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence Ontology: Class of Gene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions & Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Physical Interactions
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Summary of Genetic Interactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Interacts with | Please look at the allele data
for full details of the genetic interactions Ctet\TeTxLC allele Gene References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | DroID
- A comprehensive database of gene and protein interactions.
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Orthologs
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OrthoDB Orthologs (0)
- based on analysis using Dmel annotation version 5.41
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| OrthoDB Ortholog Groups | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OrthoDB orthology group searches Drosophila inclusive ortholog search No orthologs identified Dipteran inclusive ortholog search No orthologs identified Insect inclusive ortholog search No orthologs identified Arthropod inclusive ortholog search No orthologs identified Metazoa inclusive ortholog search No orthologs identified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ortholog(s) in Drosophila melanogaster (None identified) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No D. melanogaster orthologies identified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Orthologs (0) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene OMIM HGNC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AAA Orthologs (0)
based on analysis using Dmel annotation version 4.3
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No orthologs identified
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Stocks & Reagents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stocks Listed in FlyBase ( 10 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bloomington | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Clones ( 0 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA Clones ( 0 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cDNA Clones, Fully Sequenced | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BDGP DGC clones | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other clones | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cDNA Clones, End Sequenced (ESTs) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BDGP DGC clones | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other clones | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNAi & Array Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Antibody Information
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Other Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Discoverer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Etymology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Relationship to Other Genes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source for database identity of | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source for database merge of | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ctet\TeTxLC expressed in transgenic flies cleaves n-syb and abolishes synaptic transmission at a defined neuromuscular junction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tag or Foreign
Gene Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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External Crossreferences & Linkouts
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| Sequence Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DroID
- A comprehensive database of gene and protein interactions.
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Synonyms & Secondary IDs
( 20 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported As | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Symbol Synonym | CntE Ctet\TeTxLC TeNT TeT tetanus toxin TeTxLc TeTXLC TeTxLC TNT (Friggi-Grelin et al., 2003, Li et al., 2000, Tissot et al., 1998, Baines and Bate, 1998, Baines et al., 2002, Bauer et al., 2004, Dickman et al., 2006, Dickman, 2006, Ganguly-Fitzgerald et al., 2006, Banerjee et al., 2004, Liu et al., 2007, Rezaval et al., 2012, Chow et al., 2011, Crisp et al., 2011, Devaud et al., 2003, Hassan et al., 2005, Hekmat-Scafe et al., 2010, Sitaraman et al., 2010, Kamikouchi et al., 2010, Roy et al., 2007, von Philipsborn et al., 2011, Ai et al., 2010, Bang et al., 2011, Rideout et al., 2010, Liu et al., 2010, Thistle et al., 2012) TNTC Ttx unnamed | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name Synonym | light chain of tetanus toxin Tetanus neurotoxin light chain tetanus toxin Tetanus toxin Tetanus toxin light chain tetanus toxin light chain | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary FlyBase IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References ( 124 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Generate a list of | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| List References by type |
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Recent research papers ( 14 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Recent reviews (0)
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| All reviews listed in FlyBase were published before 2011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
