Gene Dmel\Ank2
| General Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Symbol | Dmel\Ank2 | Species | D. melanogaster | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name | Ankyrin 2 | Annotation symbol | CG42734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Feature type | protein_coding_gene | FlyBase ID | FBgn0261788 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Model Status | Current | Stock availability | 19 publicly available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Also Known As | CG7462, Dank2, CG34416, SP2523, CG32377, ESTS:149B10S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genomic Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome (arm) | 3L | Recombination map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytogenetic map | 66A10-66A10 | Sequence location | 3L:7,648,489..7,711,495 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Maps |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Automatically generated summary
See sections below for more information | The gene Ankyrin 2 is referred to in FlyBase by the symbol Dmel\Ank2 (CG42734, FBgn0261788). It is a protein_coding_gene from Drosophila melanogaster. Based on sequence similarity, it is predicted to have molecular function: structural constituent of cytoskeleton; cytoskeletal protein binding. There is experimental evidence that it is involved in the biological process: negative regulation of neuromuscular synaptic transmission; sensory perception of sound; neuron homeostasis; microtubule cytoskeleton organization; neuromuscular junction development; axon extension. 29 alleles are reported. The phenotypes of these alleles are annotated with: embryonic/larval peripheral nervous system; NMJ bouton; neuromuscular junction; embryonic/larval neuromuscular junction. It has 17 annotated transcripts and 17 annotated polypeptides. Protein features are: Ankyrin repeat; Ankyrin repeat-containing domain; Death domain; Death-like domain; Protein translocase subunit SecF, bacterial; ZU5. Gene sequence location is 3L:7648489..7711495. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| User Contributed Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Recent Updates
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| Description |
What does this section display?
This section contains items that were added to this record for each release.
It currently only tracks new links between this FlyBase report and other
FlyBase data classes (e.g. genes, references, stocks) or controlled
vocabulary terms (e.g. GO, anatomy terms).
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This section does not currently display links that were removed or gene model changes.
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| FB2013_03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FB2013_02 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| All updates | Click here to see a list of all updates to this record from FB2010_08 and on. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Detailed Mapping Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FlyBase Computed Cytological Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cytogenetic map Evidence for location 66A10-66A10
Limits computationally determined from genome sequence between P{PZ}l(3)0721708223&P{EP}Rac2EP3118 and P{lacW}Nmtj1C7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimentally Determined Cytological Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cytogenetic map Notes References 66A-66A
66A8-66A9
66A-66A
(determined by in situ hybridisation)
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| Experimentally Determined Recombination Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Left of (cM) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Right of (cM) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Notes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model & Products | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Please see the
GBrowse view of
Dmel\Ank2 for information on other features ![]() To submit a correction to a
gene model please use the Contact
FlyBase form
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| Comments on Gene Model | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene model reviewed during 5.46 Gene model reviewed during 5.48 Gene model includes transcripts encoding non-overlapping portions of the full CDS. Gene merge based on RTPCR data (FBrf0204637) Annotated transcripts do not represent all possible combinations of alternative exons and/or alternative promoters. Low-frequency RNA-Seq exon junction(s) not annotated. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Annotated Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name FlyBase ID RefSeq ID Length (nt) Associated CDS
(aa) FBtr0303120
2780
697 FBtr0303121
13793
4114 FBtr0303122
8886
2532 FBtr0303123
14018
4189 FBtr0303124
14309
4264 FBtr0303119
4752
1159 FBtr0303111
13764
4230 FBtr0303112
14130
4352 FBtr0303115
15005
4496 FBtr0303113
14438
4329 FBtr0303114
14120
4223 FBtr0303125
42128
13559 FBtr0334060
14636
4373 FBtr0334061
5268
1309 FBtr0334062
2261
547 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Transcript Data & Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported size (kB) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polypeptide Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Annotated Polypeptides | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name FlyBase ID Predicted MW (kDa) Length (aa) Theoretical pI RefSeq ID GenBank protein FBpp0292239 75.7 697
7.85 FBpp0292240 452.5 4114
4.64 FBpp0292241 279.2 2532
5.69 FBpp0292242 460.7 4189
4.61 FBpp0292243 468.9 4264
4.83 FBpp0292238 125.8 1159
7.33 FBpp0292230 464.8 4230
4.63 FBpp0292231 478.7 4352
4.59 FBpp0292234 494.3 4496
4.74 FBpp0292232 475.7 4329
4.58 FBpp0292233 463.9 4223
4.62 FBpp0292244 1488.3 13559
4.65 FBpp0306185 480.4 4373
4.79 FBpp0306186 142.2 1309
7.50 FBpp0306187 59.3 547
7.74 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Polypeptide Data & Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported size (kDa) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | InterPro
domains - A database of protein families, domains, and functional sites
• Death-like domain (IPR011029)
Ankyrin repeat (IPR002110)
ZU5 (IPR000906)
Death domain (IPR000488)
Ankyrin repeat-containing domain (IPR020683)
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences Consistent with the Gene Model
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| DDBJ / EMBL / GenBank | DNA sequence Protein
sequence Name | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/Swiss-Prot | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mapped Features | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mapped Features have been reorganized, please
see this article for details. Additional mapped features and mutations can
be found on GBrowse or related reports. Type Symbol &
Location Additional Notes References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
expression microarray
Stage
Tissue/Position (including subcellular localization)
Reference
in situ
Stage
Tissue/Position (including subcellular localization)
Reference
northern blot
Stage
Tissue/Position (including subcellular localization)
Reference
Comment:reference states 12-24 hr AEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Descriptive Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Eye-enriched transcripts determined by ratio of expression level in wild-type heads. versus expression level in so heads. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Marker for | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CV Term | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polypeptide Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
immunolocalization
Stage
Tissue/Position (including subcellular localization)
Reference
mass spectroscopy
Stage
Tissue/Position (including subcellular localization)
Reference
western blot
Stage
Tissue/Position (including subcellular localization)
Reference
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Descriptive Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ank2 isoform Ank2-PL is expressed in the axon and presynaptic bouton at the neuromuscular junction. In the axon, expression of Ank2-PL is closely associated with the membrane and with the microtubule-associated protein futsch, and organised into a lattice-like structure. In the presynaptic boutons, Ank2-PL isoform is less abundant and found adjacent to the presynaptic active zone marker brp and in close proximity to the synaptic cell adhesion marker Fas2. In the areas between synaptic boutons, Ank2-PL protein is more abundant and organised into a lattice-like pattern. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Marker for | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization (GO Cellular Component) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from direct assay inferred from direct assay inferred from direct assay inferred from direct assay inferred from direct assay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression Deduced from Reporters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
High-Throughput Expression Data
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated Tools | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference |
See Gelbart and Emmert, 2010.10.13
for analysis details and data files for all genes.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FlyAtlas Anatomy Microarray
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FlyAtlas Anatomical Expression Data (Chintapalli et al., 2007)
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
modENCODE Anatomy RNA-Seq
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[an error occurred while processing this directive] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
modENCODE Development RNA-Seq
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
[an error occurred while processing this directive]
modENCODE Temporal Expression Data (Graveley et al., 2011) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
modENCODE Cell Lines RNA-Seq
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
[an error occurred while processing this directive] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
modENCODE Treatments RNA-Seq
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
[an error occurred while processing this directive] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression Clusters
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Data & Images
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alleles & Phenotypes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Allele Phenotypes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lethality Allele lethal, with Df(3L)RM5-2 lethal (with Ank2f00518) lethal (with Ank2f02001) Other Phenotypes Allele Phenotype manifest
in Allele dorsal multidendritic neuron ddaE & axon, with Scer\GAL4IG1-1 NMJ bouton (with Ank2E380) NMJ bouton (with Ank2f02001) NMJ bouton (with Ank2K327) NMJ bouton (with Ank2RM5-1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classical Alleles ( 12 ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| For All Classical Alleles Show | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alleles Carried on Transgenic Constructs
( 17 ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| For All Alleles Carried on Transgenic Constructs Show | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aneuploid Aberrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not disrupted in | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disrupted in | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Partially disrupted in | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transgenic Constructs & Insertions
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transgenic Constructs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of
construct Name Expression
data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Insertions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of insertions Name Expression
data miscellaneous insertions insertion of enhancer trap binary system | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology: Function, Process
& Cellular Component ( 15 unique terms ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Terms Based on
Experimental Evidence ( 11 terms ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Function ( 0 terms) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from genetic interaction with Ank2 inferred from mutant phenotype | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Component | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from direct assay inferred from direct assay inferred from direct assay inferred from direct assay inferred from direct assay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Terms Based on Predictions or
Assertions ( 5 terms ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Function | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from sequence or structural similarity inferred from sequence or structural similarity with EMBL:L40632 non-traceable author statement | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Process | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from sequence or structural similarity non-traceable author statement inferred from electronic annotation with InterPro:IPR000488 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Component | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from sequence or structural similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence Ontology: Class of Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions & Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Physical Interactions
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Genetic Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Interacts with | Please look at the allele data
for full details of the genetic interactions Ank2 allele Gene References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | DroID
- A comprehensive database of gene and protein interactions.
InterologFinder
Protein-protein interactions (PPI) from both known and predicted PPI data sets.
SignaLink
- A protein-protein and protein-miRNA interaction database with multi-layered structure and multiple confidence scores.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OrthoDB Orthologs (62)
- based on analysis using Dmel annotation version 5.41
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB Ortholog Groups | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OrthoDB orthology group searches Drosophila inclusive ortholog search Metazoa inclusive ortholog search | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs in Drosophila Species
(EOG6RNBTP)
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism Common Name Gene AAA Syntenic Ortholog Multiple Dmel Genes in this Orthologous Group | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs in non-Drosophila Dipterans
(EOG6DV5V6, EOG683DCH)
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism Common Name Gene Multiple Dmel Genes in this Orthologous Group | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs in non-Dipteran Insects
(EOG63XSZM, EOG6B5N0Z)
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism Common Name Gene Multiple Dmel Genes in this Orthologous Group Apis mellifera Western honey bee Amel\GB44218 Y Apis mellifera Western honey bee Amel\GB46564 Y Apis mellifera Western honey bee Amel\GB47425 Y Apis mellifera Western honey bee Amel\GB45715 Y Nasonia vitripennis Parasitic wasp Nvit\Nasvi2EG010051 Y Nasonia vitripennis Parasitic wasp Nvit\Nasvi2EG011990 Y Acromyrmex echinatior Panamanian leafcutter ant Aech\AECH15861 Y Acromyrmex echinatior Panamanian leafcutter ant Aech\AECH21619 Y Acromyrmex echinatior Panamanian leafcutter ant Aech\AECH17403 Y Atta cephalotes Leafcutter ant Acep\ACEP11003 Y Atta cephalotes Leafcutter ant Acep\ACEP16179 Y Camponotus floridanus Florida carpenter ant Cflo\CFLO14623 Y Camponotus floridanus Florida carpenter ant Cflo\CFLO18535 Y Harpegnathos saltator Jerdons jumping ant Hsal\HSAL13195 Y Harpegnathos saltator Jerdons jumping ant Hsal\HSAL10487 Y Harpegnathos saltator Jerdons jumping ant Hsal\HSAL26919 Y Harpegnathos saltator Jerdons jumping ant Hsal\HSAL11243 Y Harpegnathos saltator Jerdons jumping ant Hsal\HSAL11614 Y Harpegnathos saltator Jerdons jumping ant Hsal\HSAL19388 Y Linepithema humile Argentine ant Lhum\LH17900 Y Linepithema humile Argentine ant Lhum\LH17830 Y Pogonomyrmex barbatus Red harvester ant Pbar\PB24205 Y Pogonomyrmex barbatus Red harvester ant Pbar\PB25065 Y Solenopsis invicta Red fire ant Sinv\SINV15011 Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs in non-Insect Arthropods
(EOG6DR7TG, EOG6C5B0C)
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism Common Name Gene Multiple Dmel Genes in this Orthologous Group | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs in non-Arthropod Metazoa
(EOG6R5BVJ)
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Organism Common Name Gene Multiple Dmel Genes in this Orthologous Group | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Orthologs (1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene OMIM HGNC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AAA Orthologs (3)
based on analysis using Dmel annotation version 4.3
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism Gene Drosophila sechellia Drosophila persimilis Drosophila mojavensis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stocks & Reagents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stocks Listed in FlyBase ( 19 ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bloomington | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Harvard | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| VDRC | v104833 v107238 v107369 v40638 v26121 v26122 v46224 v46225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Clones ( 1 ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Please Note FlyBase no
longer curates genomic clone accessions so this list
may not be complete | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA Clones ( 119 ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
This section lists
cDNAs and ESTs that fall within the genomic extent
of the gene model, which may include cDNAs and ESTs
of genes within introns, or of overlapping genes.
Please see GBrowse for alignment of the cDNAs and ESTs
to the gene model. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cDNA Clones, Fully Sequenced | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BDGP DGC clones | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other clones | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cDNA Clones, End Sequenced (ESTs) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BDGP DGC clones | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other clones |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNAi & Array Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | DRSC
- Results from RNAi screens.
GenomeRNAi
- GenomeRNAi – A database for cell-based and in vivo RNAi phenotypes and reagents
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Antibody Information
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
polyclonal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Discoverer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Etymology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Relationship to Other Genes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source for database identity of | Source for identity of: SP2523 CG7493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source for database merge of | Source for merge of: Ank2 CG32377 Source for merge of: Ank2 SP2523 CG32375 CG34121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional comments | Annotations CG34416 and CG32377 merged as CG42734 (which corresponds to Ank2) in release 5.27 of the genome annotation. Annotations CG7462, CG32375, CG34158 and CG34121 merged as CG34416 in release 5.2 of the genome annotation. FlyBase curator comment: The symbol "CG18768" has been used erroneously in FlyBase to name 2 adjacent annotations in different releases of the genome annotation. The two annotations have been renamed in release 5.1 to avoid confusion; they are CG34158 (which corresponds to SP2523) and CG34121. CG34121 was labelled "CG18768" in release 2 of the genome annotation and was not annotated in releases 3.0 through 4.3, but has been reinstated (as CG34121) in release 5.1 of the genome annotation. CG34158 (which corresponds to SP2523) was labelled "CG7493" in release 2 of the genome annotation, was labelled "CG18768" in releases 3.0 through 4.3, and has been renamed CG34158 in release 5.1 of the genome annotation. Source for identity of SP2523 CG7493 was sequence comparison (date:000414). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
dsRNA made from templates generated with primers directed against this gene tested in RNAi screen for effects on Kc167 and S2R+ cell morphology. New annotation (CG32375) in release 3 of the genome annotation. New annotation (CG32377) in release 3 of the genome annotation. Identification: as a protein that interacts with both Nrg isoforms in a yeast two-hybrid assay. The existence of this gene is tentative, and is based on a match of an STS sequence from a European Drosophila Genome Mapping Project cosmid. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Crossreferences & Linkouts
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence Crossreferences | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq (Transcripts) • RefSeq (Proteins) • • Entrez Gene
- A searchable database of RefSeq genes.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other Crossreferences | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro
domains - A database of protein families, domains, and functional sites
• Death-like domain (IPR011029)
Ankyrin repeat (IPR002110)
ZU5 (IPR000906)
Death domain (IPR000488)
Ankyrin repeat-containing domain (IPR020683)
BDGP expression data
- Patterns of gene expression in Drosophila embryogenesis
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DroID
- A comprehensive database of gene and protein interactions.
DRSC
- Results from RNAi screens.
FlyMine
- Integrated genomics database for Drosophila, Anopheles, and C.elegans
GenomeRNAi
- GenomeRNAi – A database for cell-based and in vivo RNAi phenotypes and reagents
InterologFinder
Protein-protein interactions (PPI) from both known and predicted PPI data sets.
modMine
- Data generated by the modENCODE project.
SignaLink
- A protein-protein and protein-miRNA interaction database with multi-layered structure and multiple confidence scores.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms & Secondary IDs
( 24 ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported As | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Symbol Synonym | Ank2 ank2 ank2-L CG7462 CG7493 CG18025 CG18227 CG18768 CG32373 CG32375 CG34121 CG34158 CG34416 dank2 DAnk2 ESTS:149B10S sp2523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name Synonym | Ank2 Ankyrin 2 ankyrin2 ankyrin2-XL CG32375 CG34121 Dank2 SP2523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary FlyBase IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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References ( 61 ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Recent research papers ( 5 ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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