Gene Dmel\Dhc64C
| General Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Symbol | Dmel\Dhc64C | Species | D. melanogaster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name | Dynein heavy chain 64C | Annotation symbol | CG7507 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Feature type | protein_coding_gene | FlyBase ID | FBgn0261797 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Model Status | Current | Stock availability | 10 publicly available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Also Known As | Dhc, Dhc64, cDhc, cDhc64C, Su(Gl)77 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genomic Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome (arm) | 3L | Recombination map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytogenetic map | 64B17-64C1 | Sequence location | 3L:4,807,368..4,825,733 [-] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Maps
modENCODE GBrowse |
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Summary Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Automatically generated summary
See sections below for more information | The gene Dynein heavy chain 64C is referred to in FlyBase by the symbol Dmel\Dhc64C (CG7507, FBgn0261797). It is a protein_coding_gene from Drosophila melanogaster. There is experimental evidence that it has the molecular function: microtubule motor activity; ATPase activity, coupled. There is experimental evidence for 28 unique biological process terms, many of which group under: localization; cellular component organization or biogenesis; biological regulation; cell cycle; multicellular organism reproduction; cellular component movement; cell cycle process; cellular localization; system development; gamete generation. 54 alleles are reported. The phenotypes of these alleles are annotated with: organ system; multicellular structure; organelle; cytoplasmic part; anatomical structure; organ system subdivision; cell cycle; cellular component organization or biogenesis; spindle; peripheral nervous system. It has 2 annotated transcripts and 2 annotated polypeptides. Protein features are: ATPase, AAA+ type, core; ATPase, dynein-related, AAA domain; Dynein heavy chain; Dynein heavy chain, P-loop containing D4 domain; Dynein heavy chain, coiled coil stalk; Dynein heavy chain, domain-1; Dynein heavy chain, domain-2. Gene sequence location is 3L:4807368..4825733. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenotypic Description from the Red Book (Lindsley
& Zimm 1992) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene/Allele symbols may differ from current usage | Su(Gl)77
Reduces the severity of Gl in flies raised at either
18 or 29. The most severe allele shows more normal facet
arrays in the anterior than in the posterior part of the eye.
The lamina cell body layer is thicker than normal in its posterior region and the lamina neuropil is somewhat misshapen,
particularly anteriorly. The medulla is abnormally rotated,
its posterior edge directly apposed to the lamina, but it is
more normally organized than in Gl. The familiar abnormal
projections from the posterior lamina through the medulla are
present. The second optic chiasma is also divided into
several tracts. In less extreme cases, the medulla is only
slightly rotated and the second optic chiasma is normal.
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Recent Updates
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| Description |
What does this section display?
This section contains items that were added to this record for each release.
It currently only tracks new links between this FlyBase report and other
FlyBase data classes (e.g. genes, references, stocks) or controlled
vocabulary terms (e.g. GO, anatomy terms).
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This section does not currently display links that were removed or gene model changes.
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| FB2012_01 |
Sequence features
Controlled Vocabulary Terms
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| FB2011_10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| All updates | Click here to see a list of all updates to this record from FB2010_08 and on. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Detailed Mapping Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FlyBase Computed Cytological Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cytogenetic map Evidence for location 64B17-64C1
Limits computationally determined from genome sequence between P{PZ}l(3)rG166rG166 and P{PZ}sinu06524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimentally Determined Cytological Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cytogenetic map Notes References 64C-64C
64C-64C
(determined by in situ hybridisation)
64C-64C
(determined by in situ hybridisation)
64C-64C
(determined by in situ hybridisation)
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| Experimentally Determined Recombination Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location | 3-10 +/- 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Left of (cM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Right of (cM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Notes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model & Products | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Please see the GBrowse view of Dmel\Dhc64C for information on other features To submit a correction to a
gene model please use the Contact
FlyBase form
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| Comments on Gene Model | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DGC clone GH15453 appears problematic: incomplete CDS Evidence indicates that 3' UTR overlaps 5' UTR of downstream gene; extends to coordinate AE003482:167309 (based upon 3' extent of accession L23195) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Annotated Transcripts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name FlyBase ID RefSeq ID Length (nt) Associated CDS
(aa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Transcript Data & Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported size (kB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polypeptide Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Annotated Polypeptides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name FlyBase ID Predicted MW (kDa) Length (aa) Theoretical pI RefSeq ID GenBank protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Polypeptide Data & Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported size (kDa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | InterPro
domains - A database of protein families, domains, and functional sites
• Dynein heavy chain, P-loop containing D4 domain (IPR024317)
Dynein heavy chain, coiled coil stalk (IPR024743)
ATPase, AAA+ type, core (IPR003593)
Dynein heavy chain (IPR004273)
ATPase, dynein-related, AAA domain (IPR011704)
Dynein heavy chain, domain-1 (IPR013594)
Dynein heavy chain, domain-2 (IPR013602)
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences Consistent with the Gene Model
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| DDBJ / EMBL / GenBank | DNA sequence Protein
sequence Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/Swiss-Prot | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/TrEMBL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mapped Features | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mapped Features have been reorganized, please
see this article for details. Additional mapped features and mutations can
be found on GBrowse or related reports. Type Symbol &
Location Additional Notes References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript Expression | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
northern blot
Stage
Tissue/Position (including subcellular localization)
Reference
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Descriptive Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dhc64C is the main dynein transcript expressed in ovaries and embryos. It is also detected in male testis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Marker for | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CV Term | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Notes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polypeptide Expression | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
immunolocalization
Stage
Tissue/Position (including subcellular localization)
Reference
mass spectroscopy
Stage
Tissue/Position (including subcellular localization)
Reference
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Descriptive Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Marker for | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CV Term | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Notes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
High-Throughput Expression Data
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or
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See Gelbart and Emmert, 2010.10.13 for analysis details and data files for all genes.
modENCODE Temporal Expression Data (Graveley et al., 2011) FlyAtlas Anatomical Expression Data (Chintapalli et al., 2007) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression Clusters
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Data & Images
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| Linkouts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alleles & Phenotypes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Allele Phenotypes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lethality Allele viable (with Dhc64C6-10) viable (with Dhc64C6-12) Sterility Allele Other Phenotypes Allele Phenotype manifest
in Allele metaphase & condensed nuclear chromosome NMJ bouton (with Dhc64C4-19) NMJ bouton (with Dhc64C6-10) ommatidium (with Dhc64C3-2) ommatidium (with Dhc64C6-10) oocyte (with Dhc64C6-12) ovary (with Dhc64C6-12) pole cell (with Dhc64C6-10) posterior fascicle & axon synapse (with Dhc64C4-19) synapse (with Dhc64C6-10) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classical Alleles ( 34 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| For All Classical Alleles Show | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alleles Carried on Transgenic Constructs
( 20 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| For All Alleles Carried on Transgenic Constructs Show | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aneuploid Aberrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disrupted in | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Duplicated in | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transgenic Constructs & Insertions
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transgenic Constructs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of
construct Name Expression
data heat-shock construct UAS construct reporter construct characterization construct | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Insertions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of insertions Name Expression
data miscellaneous insertions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology: Function, Process
& Cellular Component ( 49 unique terms ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Terms Based on
Experimental Evidence ( 38 terms ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from direct assay inferred from direct assay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Process | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from genetic interaction with sdt inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from direct assay inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from direct assay inferred from direct assay inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype inferred from mutant phenotype | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Component | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from direct assay inferred from direct assay inferred from physical interaction with Dlic inferred from direct assay inferred from direct assay inferred from direct assay colocalizes_with mitochondrion inferred from direct assay inferred from direct assay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Terms Based on Predictions or
Assertions ( 17 terms ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
inferred from sequence or structural similarity non-traceable author statement inferred from electronic annotation with InterPro:IPR011704 inferred from sequence or structural similarity with EMBL:N39708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Process | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
traceable author statement traceable author statement traceable author statement traceable author statement traceable author statement traceable author statement inferred from sequence or structural similarity non-traceable author statement traceable author statement non-traceable author statement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Component | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CV term References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
non-traceable author statement inferred from sequence or structural similarity inferred from sequence or structural similarity with EMBL:N39708 traceable author statement traceable author statement non-traceable author statement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence Ontology: Class of Gene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions & Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Physical Interactions
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| Protein-protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interacting group
Assay
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Genetic Interactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Interacts with | Please look at the allele data
for full details of the genetic interactions Dhc64C allele Gene References unspecified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | DroID
- A comprehensive database of gene and protein interactions.
InterologFinder
Protein-protein interactions (PPI) from both known and predicted PPI data sets.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome-wide drosophilid orthologs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curated drosophilid orthologs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | OrthoDB (Arthropod subset)
The hierarchical catalog of eukaryotic orthologs.
•
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Stocks & Reagents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stocks Listed in FlyBase ( 10 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bloomington | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kyoto | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| VDRC | v28054 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Clones ( 2 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Please Note FlyBase no
longer curates genomic clone accessions so this list
may not be complete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA Clones ( 24 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
This section lists
cDNAs and ESTs that fall within the genomic extent
of the gene model, which may include cDNAs and ESTs
of genes within introns, or of overlapping genes.
Please see GBrowse for alignment of the cDNAs and ESTs
to the gene model. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cDNA Clones, Fully Sequenced | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BDGP DGC clones | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other clones | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cDNA Clones, End Sequenced (ESTs) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BDGP DGC clones | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other clones | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNAi & Array Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | DRSC
- Results from RNAi screens.
GenomeRNAi
- GenomeRNAi – A database for cell-based and in vivo RNAi phenotypes and reagents
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Antibody Information
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
polyclonal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Discoverer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Etymology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
"Laborc" named for a Hungarian family that vanished by the beginning of the 14th century. Mutation is named after a Hungarian clan that vanished by the beginning of the 14th century but their names survived in the names of settlements. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Relationship to Other Genes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source for database identity of | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source for database merge of | Source for merge of: Dhc64C Laborc Source for merge of: Dhc64C Su(Gl)77 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNAi screen using dsRNA made from templates generated with primers directed against this gene causes spindle pole detachment when assayed in S2 cells. This phenotype can be observed when the screen is performed with or without Cdc27 dsRNA. dsRNA has been synthesised for this gene and transfected into S2 cells. S2 cells treated with this dsRNA arrest in metaphase, require 50% more time to form a metaphase plate than untreated cells and exhibit centrosome detachment and spindle focusing defects. Dhc64C is required to maintain mRNA at its apical localization, following transport, in the blastoderm embryo. S2 cells transfected with dsRNA made from templates generated with primers directed against this gene causes detachment of centrosomes from the spindle poles, resulting in a slight increase of spindle size. Mitotic S2 cells treated with dsRNA made from templates generated with primers directed against this gene display a striking detachment of centrosomes from spindles and a loss of spindle pole focusing, resulting in an increase in pole-pole spacing. There is also an increase in spindle length and an elevation of the mitotic index. dsRNA made from templates generated with primers directed against this gene tested in RNAi screen for effects on Kc167 and S2R+ cell morphology. Dhc64C may be involved in the prevention of centrosome assembly in unfertilised eggs, and establishing harmony between the chromosome and centrosome cycles. Spindle pole movements in embryos are directed by a temporally coordinated balance of forces generated by three mitotic motors; cytoplasmic dynein, Klp61F and ncd. Dynein acts to move the poles apart throughout mitosis, and this activity is augmented by Klp61F after the fenestration of the nuclear envelope, which occurs at the onset of prometaphase. ncd generates forces that pull the poles together between interphase and metaphase, antagonising the activity of both cytoplasmic dynein and Klp61F and serving as a brake for spindle assembly. Mutations in Dhc64C disrupt fast organelle transport in both directions in axons. Dhc64C function is required for the attachment and migration of centrosomes along the nuclear envelope during interphase/prophase and to maintain the attachment of centrosomes to mitotic spindle poles. Identification: PCR screen for Dynein heavy chain genes. Mutant analysis of Dhc64C reveals cytoplasmic dynein is required at two stages of oogenesis. The localisation of dynein in mitotic cysts suggests spindle orientation is mediated by the microtubule motor cytoplasmic dynein. Later in oogenesis dynein function is necessary for proper differentiation. Early in oogenesis mutations disrupt spindle organisation in dividing cysts and block oocyte determination. Cytoplasmic dynein encoded by Dhc64C is essential for Drosophila viability and for cell viability in several tissues. Clonal analysis suggests that cytoplasmic dynein mutations are cell lethal, and maternal supplies are sufficient for development to larval stages. Cytoplasmic dynein is required for the proper formation of the oocyte early in oogenesis. Later, during oocyte growth, dynein is required for the transport of materials from the nurse cells to the developing oocyte. Dhc64C protein acts as a minus-end directed motor that promotes microtubule translocation in vitro. Dhc64C encodes a cytoplasmic dynein heavy chain polypeptide. Dhc64C has been cloned and characterised. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Crossreferences & Linkouts
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| Sequence Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq (Transcripts) RefSeq (Proteins) Entrez Gene
- A searchable database of RefSeq genes.
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| Other Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro
domains - A database of protein families, domains, and functional sites
• Dynein heavy chain, P-loop containing D4 domain (IPR024317)
Dynein heavy chain, coiled coil stalk (IPR024743)
ATPase, AAA+ type, core (IPR003593)
Dynein heavy chain (IPR004273)
ATPase, dynein-related, AAA domain (IPR011704)
Dynein heavy chain, domain-1 (IPR013594)
Dynein heavy chain, domain-2 (IPR013602)
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| Linkouts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DroID
- A comprehensive database of gene and protein interactions.
DRSC
- Results from RNAi screens.
FlyMine
- Integrated genomics database for Drosophila, Anopheles, and C.elegans
GenomeRNAi
- GenomeRNAi – A database for cell-based and in vivo RNAi phenotypes and reagents
InterologFinder
Protein-protein interactions (PPI) from both known and predicted PPI data sets.
modMine
- Data generated by the modENCODE project.
OrthoDB (Arthropod subset)
The hierarchical catalog of eukaryotic orthologs.
•
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms & Secondary IDs
( 40 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported As | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Symbol Synonym | CD cDhc Cdhc cDhc64C CG7507 Dhc (Weil et al., 2010, Li et al., 2010, Murthy and Schwarz, 2004, Wojcik et al., 2001, Ji et al., 2002, Pilling and Saxton, 2000, Johnstone and Lasko, 2001, Pilling and Saxton, 2001, Siller et al., 2001, Pare and Suter, 2000, Swan et al., 1999, Iyadurai et al., 1999, Iyadurai et al., 1999, Starr et al., 1998, Pare and Suter, 1998, Phillis et al., 1997, Waterman-Storer and Holzbaur, 1996, Navarro et al., 2004, Griffis et al., 2007, Siller et al., 2005, Papoulas et al., 2005, Weil et al., 2006, Horne-Badovinac and Bilder, 2008, Boylan et al., 2008, Zimyanin et al., 2008, Sung et al., 2008, Dzhindzhev et al., 2005, Weil et al., 2008, Toda et al., 2008, Iyadurai et al., 2008, Mische et al., 2008, Hamilton et al., 2009, Trucco et al., 2009, Lerit and Gavis, 2011, Van De Bor et al., 2011) dhc DHC (Sharp et al., 2000, Cytrynbaum et al., 2003, Sharp et al., 2000, Silvanovich et al., 1998, Gindhart et al., 1998, Morales-Mulia and Scholey, 2005, Kim et al., 2007, Haghnia et al., 2007, Riggs et al., 2007, Rogers et al., 2008, Navarro et al., 2009, Ally et al., 2009, Loschi et al., 2009, Satoh et al., 2008) Dhc46C Dhc64C (Finan et al., 2011, Li et al., 2010, Wehr et al., 2006, Cox and Spradling, 2006, Delanoue and Davis, 2005, Wodarz, 2002, Liu et al., 2000, Harris and Peifer, 2005, Ghosh-Roy et al., 2005, Pilling et al., 2006, Goshima et al., 2007, Goshima et al., 2005, Christensen et al., 2008.4.15, Martin et al., 2005, Kaltenbach et al., 2007, Horne-Badovinac and Bilder, 2008, Li et al., 2008, Mische et al., 2007, Yang et al., 2008, Font-Burgada et al., 2008, Trammell et al., 2008, Zhang et al., 2009, Satoh et al., 2008, Junion et al., 2007, Wainman et al., 2009, Anderson et al., 2009, Gaspar and Szabad, 2009, Li et al., 2008, Liu et al., 2010, Wasbrough et al., 2010, Wasbrough et al., 2010) dhc64C Dhc64c DHC64C Dynein Fs(3)Lab Fs(3)Laborc Fs(3)Sz18 HMW MAP l(3)64Ca Lab Su(Gl)77 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name Synonym | Cytoplasmic dynein cytoplasmic dynein cytoplasmic dynein heavy chain Cytoplasmic dynein heavy chain cytoplasmic Dynein heavy chain cytoplasmic dynenin dynein dynein HC dynein heavy chain Dynein heavy chain Dynein heavy-chain dynein heavy-chain Dynein heavy chain 64C dynein heavy chain 64C dynein heavy chain at 64C Female sterile(3)Laborc Laborc Suppressor of Glued 77 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary FlyBase IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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References ( 222 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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