FB2026_02 , released June 18, 2026
Decorated region view

Decorated region view for TrpA1 (3L:8,894,404..8,905,200 [-])

Note that all features in the given genomic region are shown, including alternative intron/exon structures for a gene, and any overlapping features from different genes. Viewing the decorated region alongside a JBrowse view of the region is recommended.
Legend
Intergenic region
xxxxxx
UTR (or ncRNA)
XXXXXX
CDS
XXXXXX
Intron
xxxxxx
>3L:8894404..8905200 (reverse complemented)
GCTATCGAGGCTGTCGGTTCGCAAATCACTCAGCAGGAAACTCACAGGAATATTCGACCC
CTTTGAACAAATTGTACATCAAAAGGTGCTAATTAAGTTTCATAATTAAATCCATCAGTG
TCCATCAGAGCTGTGAAAGTTTGAGCACAATTTAGCTATATCCTTAAGCACCATCCCTTT
GCCTTTGCAGGCAGAGGCCAAAGTCCTTGCTCGCGTTCTTATAGTGCTTCCTCCACGTCG
CAGTAGAGGATCGAGAGTGAAACATATGGCAAGCAGCCTTAAATGCTGCTAAACTCAGTG
CGAAAATATTCGGAAAATTCCTGCTGCTGTCGCAGTTGTGCCTGCCCCGTGTGCTCCGTT
CTAGTCTTGGCCGAAATCAAAATCAAATTCAAGTTTTTTAAATTCAAAGTCGATTGAAAA
TGTAAGTGCATCCTGTCAGCTGCTCTCCAAGAAAATACCAAACGCGCTGAGTGGAAAAAC
GAGCTAGGGTTTGAATAGTTGGAATATAGCAAAGgtaaggcaataatctgaataatatat
ccaccatttttgcaagaccatgtagatagtgtactcatgacccaaagtaaccccttaaat
ttccctttaattaagggatttatttacccgatggcccgtcaatgtttgctctgatatttg
cccaccatcaccacttagactaatcaaaaagcctctagttttgtcaactcatccaattgg
gtgtagaaataatcagagctttttttctcacctaaggcttagtacctctaatttcattag
acggaaatcgtccaaatcatctgataagtatctcttcaatgtaattaaatgttcaatacc
cgcctagaaatatctgcgcactatgagaagccttgcagtttgaatcctttgctcgtcgaa
agcagttcgaaaatggggctggcggaagttaagtaagtctggatttacaaaggcttggca
ttatgcaaatttctccagtcgagtggcgaaaataaacaaaccattaattagacagttcca
gttaatgggcccgcgaaagggagtcccggcttcgattccctcgggcggcagtggctataa
atgtgtagaatgacaaatggccattgacttgctagccagctgtacttttatacatacagt
atatatatacggctcagtgcgtgtaaattggccaagggttactgctaaattagccctagt
tgcagttacgcttcagttctagtccgacacagttgtatctagtgtgaatcgtcgtatcgc
tcgtatctcctatatctggcgatatcatgtgacacacggtttatctaaattgctttgctg
tcggtttacgcgtttgcaaaccgtttaacccaatcaatatctaattagtccactgattgc
tgcccagcccgatgatgtttgataagttgcaaaatacaaacgaggcactaaccagcgcgt
acagTCGCGACCAGCGGCCCTTTATGATTACAGCTCCGGCCACGGCCACGGAACGCAACC
AGAGTTCCAAGAGCACCAGGATGCCCAAGCTCTACAACGGAGTCTACAGCGGTCAGTGCG
GCGCCCTATCGCCACCTGACCTCATGGAGGCCCAGCCGAAGCTACTTCCCAAGCCAAGGA
GCAACAGCAGCGGCAGCACCGGCCGGAACAGCAAGgtatgaaacagcaaaaaagaaaaat
gattcttttttgtataatagggatagcttttatttaaaatctgtgccaattcctcaccta
tggtgacgccaggtagatgtgctcttctcagataaaaaaacccccgatgagattcgaact
tacgatctcctgtttactagacaggcgctttgcccaactaagccacggcgccacattttg
aaatttatgataatattattttattaaaatcatgttaatattggttttaaagcagtttga
acctagaaaaatatattaattatattctaaattaagaagtgaagtggattaaatatacta
gacctattcgaatttcagttcgaactcgttcgataatattccattttataattagccagc
acttataaataatttatgacttaacataacttaaccaatttgacatctttttgcagTATT
GGATATTTTCAATGATAATCGAGCGCAGTGCGGGTCCCAAGCGGATTGAAATCGATGGCG
ATGATGCGGACACGCCGCTGGAGGCCATCCTGCCAGCCGAACCGCCGGCGGAGGTCTGCC
TCTTGCGTGACAGCCCCTTCAGGATATTGCGGgtgagtagatccagaatgggttccatgc
aggtgcgggccggcaattctccaaagtgaagacccgaggcaattcccgcagcgagagcca
tgataaatgcttctcgatgtgcacctagcctcgtgttttgaatgttcgagaagcggccaa
ggaagcccgatagatattattcaataaaatgtcaatcgttttttttataaaaaatataaa
agaacacttatgaagacttaagcaaatataagttattttaatgacttatattcaagcagt
taacagatccattgaggatatttttacctagaagtgattggagcaacaagtcctttttcg
cattcagcgccagagaaagaaagattgaaattgaaaccaaaattgaccggcgagttcaac
aaaataacacgaagcgcatccttctccaaaaggacctgtgccacacgcacccgaagttgc
cgccagttggctataaaagcaagactgtttggtccgagatttcagtcattcagcgactct
tcccgcgtggactcaacctttttttttcctctggatatatttactctccgtcgagcttac
caaaaatcaagttaacttggcagcaaatcagtggcacagcaatttcatttattacatttg
tggcagttaactaactcaataacgacttgtgctaaagaaaaaaaagtttatacacaaaac
cgtgcaacaccaaggatattttacacatttaaaattcgtatgacaagtgaacgcgaattt
tgaaaaattaactttaatacattccacagtacaaatataacattaaatatacaaaatatt
gctcaaatagtgataacaactgaacttgtttttttttttataacaataacaatatataca
aaactgcaatttatgaaacgtacgcatatcaaagctgcaagtcttctgattatcgcaATC
TAATTGAGTTTCGATCGGAATTAAAACACCAAACGAACTGCAAAACAGAGCTGAATTCAT
AAGATGAGCTAAAGGACTCAGTTCATAAGTTCGCATAACCAAACTACAAGCTGTCGTAAC
GAAACGCTATTTCTGGAATGCAAAACGCATTCTAATTGAATGTCCACTGGCATTAAGGAC
CCATTGAGTCATCACGTAAAGGCAGAAAATCAGAAACTGAATTCAGAAGGCACAAGGCGA
ACGCATATGGAAATCATATTGGAAAAAATCCATAACAAGTCAAGGCTCTCTCGAAACTTC
GTCCGATGTTGCCAGCTGAGCTGTAAGGACAATAAGAGTTAATCCACTAACTAAACACAA
ATGTAATTAAAGTCGACAATGACTTCGGGCGACAAGGAGACTCCTAAGAGGGAAGATTTC
GCCAGTGCGCTGCGATTCTTGATGGGCGGCTGTGCCCGCGAACCGGAAATGACTGCAATG
GCGCCGCTTAACCTGCCCAAAAAGTGGGCACGCATCCTGCGGATGTCCTCGACTCCAAAG
ATACCAATCGTGGACTATCTGGAGgtaaaactgcagccggcgaactcattaaattagcca
cgcgcgaatcacaaaatgacctctctgggttggctaaaagtttcatttcaccccctcctt
ttaagtgattcacagaattatactcctggacatttccagaaaaacgctgttcaatacagt
gttttcaaattctttttttttttttttttgaagaaaacaggaaaggcaataagacaatca
aattactcagtcgccggaaggcgttaatgtcctaaaatctattgacattttgctgtagga
caatgttttgcactttctttgctttgcactacgaaaggcaaacagaaagttcttagagaa
agtaaatgaaactaaaagaacttcgccttgaactagcaaagcacctttataacacaaaaa
ttaaaagaaaaaataaattgcatgcaaaagaattttgtattgttatgacattttaattta
ttaacccgaaggaagttaaagactcggaatactaggaatgttcctcacctccgaacaaga
gttcaaaatcagttttataaattaaaatttttcttaattaagtatttttcccagtgctgg
caaaccaaacatagcttaatgttttaattgatgttgctgcaaagtgaaagacacctgttt
ttcctgtttcagGCGGCTGAGTCCGGAAACCTTGACGACTTCAAGCGACTCTTCATGGCG
GACAACTCGCGCATTGCTTTAAAGGATGCGAAAGGACGAACGGCTGCCCATCAGGCGGCG
GCCCGTAATAGGGTTAACATTTTGCGGTACATTCGCGACCAGAATGGCGgtaagtgaacg
gataaagccattaacccggactccttatcaagcgtgatttacagACTTTAATGCGAAGGA
TAATGCCGGCAATACCCCGCTCCACATCGCCGTGGAGAGCGATGCCTACGACGCTCTGGA
CTATCTATTGTCCATgtaagtggctcaagccatggttgatttagcccgattgaacttcaa
aatatatcttgccgacaatccttacagCCCAGTGGATACGGGAGTGCTGAACGAGAAGAA
GCAGGCACCAGTGCACTTGGCCACCGAGCTGAACAAAGTGAAGTCCCTTCGGGTGATGGG
TCAGTACCGCAATGTCATCGATATTCAGCAGGGCGGCGAACATGGACGTACCGCTCTGCA
CTTGGCCGCCATCTATGATCACGAGGAGTGCGCTCGCATCCTGgtaagtggtgtgagttt
tggccaatcatttcatttgattattttttatgttcggccttgcttttgtatttactcatg
cattttatttgcattggtttgatttatattaagccattaatcaacttgattcacccacca
tcgtcctttcgaaaaacacactcatccgtacaaaagtttaatttatcatagagaacatga
aaaataaaggttggtatatgcagtagaagaaaattgaaattgttttgcctgcttttatac
tagacccaaatattaaagagtgtgtctgtgtgcgtgtgtgtatgttcctagtgctagcat
attatattagacgcatttatatttgtttacaataactcatcgtatcttccagATAACTGA
GTTCGATGCATGCCCACGTAAGCCCTGTAACAATGGTTATTATCCCATACACGAAGCGGC
CAAGAATGCCAGCTCCAAGACAATGGAGGTCTTCTTCCAGgcaagttatcctttccattt
cccgattcgcacttgtcccagctgcatgctacaactacgagtatgtcatctcatccagct
ttgatcctattgtggaagctatccccattggacactgacccgatttgcttgattcctaca
actcctacccctcttacttactttcttacttacatcccatccagacctttcgtgcactct
cttcggttttgggtttatttttatttggtttttgattttgctttgctccttgattgaagt
tgcgtatacgccgcgttgtcagcgacctctttaaaaagtatcaaatttgttatgggtcac
actgtcgctgtcgagagttgaaaggcatggagaataacatgttttccacaaaattttaag
ctgcagaaaaatatcagatgttggataactcaggcggggtcggtcattcactttggacaa
cagtttactggtcgccttaagacacttctaggatgcccaaaagttaaagcgttgcaaaaa
aaaagaaaaaaaaaacagagtgatgtgttattttgattgcttttcttgacttggtttact
taaatgtgtaatcaattatagaaggaatgttcttagatataagtatgagcttagactgca
ctgccgcttcatagaattacttgttcaagttttttaatagtaatttaatcttttgtgtag
ctattgttattaatatattgacacctgcttttaaaagctgtcttaagaccattgaggata
aatacgagaacggtgacgcaaacaagtctgttaatttctttttttcacaattaaatctct
gcaggaatgagctcatctaatgtttttattcattttccagTGGGGCGAGCAGCGCGGCTG
CACCCGCGAGGAGATGATATCCTTCTACGACTCGGAGGGCAATGTGCCGCTCCATTCGGC
TGTCCATGGTGGCGACATCAAGGCTGTGGAGCTGTGCCTCAAGTCCGGGGCCAAGATATC
TACGCAGCAACACGATCTCTCGACGCCAGTGCACCTGGCTTGTGCCCAGgtgagtgtatg
ctttggatgcacaggtgtgctgatgactgggaaatccttcagcggcgaccaactgacagt
ctgccaagcaattgaaaactctcatatttccacgtggagttgagcaaacaaagcgttctt
ggccagtaagcgaaaggaaaacagcattaaagcatatccaatgggcggtgaaaagtggct
gtggtggtttcctttcggtctccttcggattgcctcgtgtcttggtgtccttagttgact
ttaatttgacaaattcttatgcaaattcactaagaagaacgtgactttgccgttaacaaa
acaaagcacttttcatgttggggaaatacatactacggatgaatgattccgacatggttt
tccatttccatttccgcttcttgttctttttgtttttttttttgtctagGGAGCCATAGA
CATTGTAAAGCTCATGTTCGAGATGCAGCCAATGGAGAAGCGACTATGTCTGAGTTGCAC
GGATGTGCAGAAGATGACGCCGCTGCACTGCGCCTCCATGTTCGATCATCCGGACATTGT
GTCCTATCTGGTGGCCGAGGGAGCGGACATCAATGCCCTGGACAAGGAGCATCGCTCTCC
GTTACTGCTGGCGGCATCTCGTAGCGGTTGGAAAACAGgtgaccttagttaaccctttta
tatatctattgtgtaaacttggctttccatttttccagTCCACCTCCTGATTCGCCTGGG
GGCGTGCATTAGTGTCAAGGACGCCGCCGCCCGCAATGTGCTGCACTTCGTCATCATGAA
CGGCGGCCGGCTGACGGACTTCGCGGAGCAGGTGGCCAATTGCCAGACGCAGGCGCAGCT
GAAGCTGCTGCTCAACGAGAAGGACAGCATGGGCTGCTCGCCGCTGCACTACGCCAGTCG
GGATGGACACATCCGTTCGTTGGAGAACCTCATTCGACTGGGAGCCTGCATCAACCTGAA
GAACAACAACAACGAGAGTCCGCTGCACTTTGCCGCACGCTACGGAAGATACAATACGGT
GCGGCAGCTCTTGGATTCCGAGAAGGGATCCTTCATCATCAACGAAAGTGACGGTGCAGG
GATGACACCACTGCACATATCCTCGCAGCAAGGACACACGCGAGTGGTGCAGCTGCTACT
CAATCGAGGAGCCCTGCTCCATCGGGACCACACCGGACGCAATCCTCTCCAGCTAGCGGC
CATGTCCGGATACACCGAGACCATCGAGCTGCTGCACTCGGTGCACTCGCATCTGCTCGA
TCAGGTGGACAAGGATGGGgtgagtgataatacttggcaacttggttaatcaaggtaacc
attaaacatggctaatccccattagAACACCGCTCTTCACCTGGCCACCATGGAGAATAA
GCCCCATGCGATCTCCGTGCTGATGTCTATGGGCTGTAAGCTGGTCTATAACGTTCTGGA
CATGAGTGCCATTGACTATGCCATCTACTACAAATATCCGGAGGCTGCCCTGGCCATGGT
CACCCACGAGGAGCGGGCCAACGAGGTGATGGCTCTGCGTTCCGACAAGCATCCGTGCGT
GACCCTCGCCTTAATTGCCTCCATGCCCAAGGTATTCGAGGCGGTGCAGGACAAGTGCAT
TACCAAGGCCAATTGCAAGAAGGACTCGAAGAGTTTCTACgtaagtttgtcgttttccca
gggtgaagcccaatcatcatctcattccatcgaagctaattgatttctattcgcccccat
tgacatcgccgtgaccagatcaaatactctttcgcattcttgcaatgcccctttatgttt
gccaagattgatgagaaaaccggagagtcgattacgaccgccagtcccattccgttgccg
gctttgaatgtaagcggaaactggaatccttcccagatctgttgcatgcgtgttttttta
atgttgctcctccttcctggccttgatacgtgatcttggggttattgtgggctgggatgt
agcccacaatcgagtatagaatgaggtttagcgggcacatcatgatccataattcatatt
aatggctaagttccatacatcgatactcattacttggttaccatccagATAAAATATTCG
TTTTGGCCCTACCAAAAGACACCCGAACAGATTGAGGCCAAGCGCAAAGAGTTCAATGAC
CCCAAGTGGCGACCCGCGCCTTTGGCCGTGGTGAACgtgagtgtccccgaactctcttaa
aggtcccagagctctgcaattgtgaaccgtcccccaaactaacccactaaccgactcact
ttccggcttttgtatcttgtatgttgtgtgcgtgtttattagactttatgctacccattt
ctgatatatgtttccctataatccctcgatcagACCATGGTAACACATGGCAGGGTGGAG
CTGCTGGCCCATCCGCTCAGTCAGAAGTATCTGCAGATGAAGTGGAACTCCTACGGCAAG
TACTTTCACCTGGCCAACCTGCTAATCTACTCGATATTCCTGGTCTTTGTAACCATCTAC
TCTTCGCTGATGATGAACAACATCGAACTGAAGGCTGGGGACAACAAGACGATGAGTCAA
TACTGCAATATGGGgtgagttgagatcatagttacccgaaaacatatagcaacacctcca
tttttcagATGGGAGCAGCTGACCATGAATCTCTCGCAGAACCCGTCGGTGGCATCACAG
ATTCGTTTGGATTCCTGCGAGGAGCGTATAAATAGAACCACTGCAATACTTTTCTGTGCG
GTGGTCATCGTGGTCTATATACTGCTCAACTCGATGCGGGAACTAATACAGATATACCAG
CAGAAATTGCACTATATCCTGGAGACAGTTAATTTGATATCCTGGGTGCTGTACATCTCG
GCTTTGGTGATGGTAACACCGGCATTTCAGCCGGATGGAGGAATCAATACCATTCATTAC
TCGGCCGCTTCAATAGCAGTCTTTCTGTCGTGGTTCCGATTGCTACTGTTCCTGCAAAGA
TTCGACCAGGTCGGCATCTATGTGGTCATGTTCTTGGAGATTCTGCAGACGCTCATTAAA
GTGCTGATGGTATTCTCCATACTTATAATCGCCTTTGGTCTGGCTTTCTATATACTACTT
TCAAAGgtaggtgcttttatttggatttttcgagtgagatatttcctacttatcccttag
ATTATTGACCCCCAACCGAACCACTTGTCCTTCTCCAACATACCCATGTCCTTGCTGCGA
ACTTTCTCAATGATGCTGGGCGAGCTGGACTTTGTGGGTACCTATGTGAACACCTACTAT
CGGGATCAGTTGAAAGTGCCCATGACATCCTTTTTGATTTTGAgtaagtattgtttacac
cattacatttccttcaattgatattaaatttattatgtcagGTGTCTTTATGATCCTTAT
GCCCATTCTTCTGATGAACTTGCTCATCGGTTTGGCCGTCGGCGATATTGAGTCAGTGCG
TCGCAATGCCCAGCTCAAGAGACTGGCCATGCAGGTGGTGCTCCACACGGAGCTGGAGAG
GAAGTTGCCCCATGTCTGGCTGCAGCGAGTTGACAAGATGGAGCTGATTGAGTATCCCAA
TGAAACCAAGTGCAAGCTGGGCTTCTGCGATTTCATCCTGCGCAAGTGGTTCTCGAATCC
ATTCACCGAGGATTgtaagttgtctgggaaaagatctggtactaggtccatccaatacac
tttcaacttctatgcagCCTCCATGGACGTCATCTCCTTCGACAACAATGATGACTACAT
CAACGCAGAATTGGAACGGCAGAGGCGAAAGTTGCGCGACATAAGTCGCATGCTGGAGCA
ACAGCACCATCTGGTTCGGCTCATTGTCCAAAAGATGGAGATCAAGACGGAGGCGGATGA
CGTGGACGAGGGTATATCCCCAAACGAGTTGCGATCCGTCGTCGGTTTGAGATCGGCAGG
CGGAAATCGATGGAACTCGCCGCGAGTCCGGAATAAACTCCGAGCCGCCCTGAGCTTCAA
TAAGAGCATGTAGATCCCTTCGTTCGAAGGAACTTGGCTTTATAACAAAATCTGTGTATC
GTCCTTAGTAGAAAAATTGCACCATTTTTAATATATCTCTATGTGTGTGTAAATCGTTGT
CCCACAGTGACGTGGATCGTGTGTGTATGTGACGATCGTATTGTGTGAGGTCCTGAAAGG
AATAATACATCGAATTTATAGGCAAGGATCATGGGCTGTTCTCGTAACTTGATTAAGCTG
TGGAATTCAACAGATCTATTGTAGTTTTAAATGCAATTTGCAAAAGTGTGTATTGTT