FB2026_02 , released June 18, 2026
Decorated region view

Decorated region view for sqd (3R:13,634,862..13,646,304 [-])

Note that all features in the given genomic region are shown, including alternative intron/exon structures for a gene, and any overlapping features from different genes. Viewing the decorated region alongside a JBrowse view of the region is recommended.
Legend
Intergenic region
xxxxxx
UTR (or ncRNA)
XXXXXX
CDS
XXXXXX
Intron
xxxxxx
>3R:13634862..13646304 (reverse complemented)
ATAAATCAAAGCTGCCATACTGCAAGCAGACAAGTCACGCGCCCATTTAGCTCCTTATAT
AGGCTTATTTGGGGTGGTATCGTACAGAAAATCCCAATTTAATCCTTGGCAAATGTATAG
CTAACAATCTCCAGGTAGAGCAAGCAAATACAATACAAATATTTACCAAAATAATACCAA
ATCGACTTGACTGGGAAAACATCAAGGTGGCAACGCCGCACCCATATACACACGCTGTCG
TTTGCATTTATCATTTTCCGGTCGTCATTTCATTCGTACGCGCGACTTTTTGGCGAGTGT
GTATAAAAATCTCCGGCTCTGCGTAAAAAACGAATATCGTGCTGCCTAGCCCCCGAAATT
AGTAGATCAGTCGAAAACACACAAAATGGCCGAGAACAAGCAAGTGGATACAGAAATAAA
CGGCGAGGATTTCACCAAGGACGTGACTGCCGACGGTCCGGGATCTGAAAATGGTGATGC
GGGCGCCGCCGGCTCGACCAACGGCAGTTCGGACAACCAATCGGCCGCATCCGGCCAGCG
GGACGACGACAGgtatgtccattatccggcggatacgttttttttttgttcttttttatt
tttgcaacgggcaaccgatgatcatgtgccccccatagattttctgcttctacatagtgt
atattgcctactctgttacgtaaatgcaaagctaacgtcgttggtcgagtttcattggat
tttacggggttctgcgggggaagtctgaccccttttgtgttctctctcgcttgcgctcgt
gcgtcggagtgtgtttaagtgtgtgtgtgtgaggtgtcggtgcgactgtacttcagtcat
attaatagaatcttcgggccaaaatgcatcatcacagtctcgggagacatggaaaatttt
caacgttttcccctgcacacacacgcactttccgcaatgaaaaccagagttttcttaagc
taggagcacattttctcccctttgtgaggttatgtttgtttcccacgttgccccacagac
acactgtgacgcatacgaacacaaatcatacggttgcctttcacttgcaaaaaatgtggc
gaaaaaaaacgttggaaaaagttatgtttgtatttgtcagtgtattctttttaattcgca
ttactctttgtttcggctatttcgttgttattttgtgctcttccagttttgtacccaaaa
tggcggctgcatacaggcatacataccaacctaacgcccgctgttctgtaggtgtgtgcg
tgttttgcagttttcacttattctcttgcttgccggcttcgctcgctcgccacctctttt
gcgcgctcttactctcagagagcgacagccggcgttgtttggagttgccaaggcgccaaa
atattaatttaacgaacaattaatgtaaattataaatgataaataattttgatggattaa
agcatagagataatgatgatcaagtagaatggtcctcttgtttgctcccctgcgttttgg
tttttaggtctagcgtacacttcatttgcccatcctttatgatcattttatatctaagtt
taatcttaagtcacacgatactgtacatttaaacgataatacgaaaccagcgctgacgaa
gcagatgcagattattccccgtaaaggaagaaggacgaaatggagaaattaaatcgaaaa
tcatagcttatcctgttgtcttgtgagcgaactaaccttgttcctctccggcagGTTTTG
AGAGAAGTGAAATGCCCCAGGTCAGGGTTTTAAGCTATGCTCAAGACGGATATGGATTCG
GATATGGATTTGGATTCGTATTCCTGCCCCCGGCAAACGGTTACGGATTCGGATTCGGAT
TCGGCGGACTTATACTTGGAGGATATGCAACCCTCTCCACACTCCAGTCTCCAAAAGTCT
CCGCTCCGCCGATACTGATGCTGATGgtatttatctatccaaaactaaaacaaacaaaca
atcagtcagtcagccaatatatagaactatcaacacacaaaattatcaagaaataatctc
gatttaaaattggatccatatgtaaactgtatacgagtatatattgtattgtatctctta
acgtataacttgtaaattacctaaaaaaaaaagaaaaacaaaaaagtaccaagtaatcgg
agacagagagagaccgagtgaaaaagagactcgcagttttttcgttttgttttatgaagc
tcaaaaactatacattatatatcgcccgaagaaagaaacacaatgaacgaatgtaacgta
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gtgatgagactgttccaaatttgccgggaatccgccgagaacgatgagatatctttccaa
aaagtccagaaatcaatgagtaacgtacacatcatagtaaactataagtgtctgcatatt
ttttcaacattcctttttataaaaaaaaaaaaatataaaataaaataaacagccaaataa
agaaagtaaaactaaccacaatccagcataaaaacctttgcattcttttctctcatccta
ttgaataaagactaattgttaattgttatttgtacagacaaagactcttaagcataccca
aaacaaaaacttaataattcactcttgcatatcttatatatactatatatctatatcttt
cgctcgttttgtgtctctcgatcgatcgctcgctcgctcctcgaactctttcgctcattc
cgagtttgcaagtattttgacactatccgatcaattctttgattgcaatacagtaactaa
agcaatttttcacttcaaatttggtgagttttttttattcgttttgtattcttgcccagt
catcaaattcttttgcagccaatacgaaaatcagtaagagaagaaaaaatttaaagtaaa
ttaagaaagtatttgcctcgcgcatcaaacacaacctatttttcgtgcctgattttccca
gataaaccttttcctaccaaaatatttccctaaatctatattgaaatgttttaagatacc
atcaatctaaccaattaatctttaaactttcgcagGAAACTGTTTGTCGGTGGTCTGAGC
TGGGAAACGACTGAGAgtaagtataaaactaaaacgaagtaaataaacaaatgctaacaa
gttgcttttctattatttcagAGGAACTCCGCGATCACTTCGGCAAATATGGCGAGATCG
AGAGCATCAATGTCAAGACAGATCCCCAGACCGGTCGGTCCCGAGGATTCGCCTTCATCG
TGTTTACAAACACCGAGGCCATTGACAAAGTCAGCGCCGCGGATGAGCACATAATCAACA
GCAAGAAGGTCGATCCCAAGAAGGCCAAGGCCAGGCACGGCAAGATCTTTGTCGGCGGCC
TCACCACAGAGATCAGCGATGAGGAGATTAAGACCTACTTTGGACAGTTCGGCAATgtaa
gtaaccctaaagcggtagaccttttggaatttgccaataatgatttacttaaattctttt
tgtttaaagATCGTCGAGGTGGAGATGCCATTCGACAAGCAAAAGTCGCAGCGCAAAGGA
TTCTGCTTCATCACCTTCGATTCGGAGCAGGTGGTGACAGATTTGCTGAAGACGCCCAAG
CAGAAGATCGCCGGCAAGGAGGTCGATGTTAAGCGTGCGACGCCCAAGCCGGAGAACCAG
ATGATGGGCGGTATGCGTGGTGGACCACGCGGTGGTATGCGCGGCGGACGCGGTGGCTAC
GGAGGACGAGGTGgttagtacagccgctaacgaagcagtgcatttttgcttcttatggaa
accggctctaaactatatatttcacaccatcccatagGCTACAACAACCAGTGGGACGGA
CAGGGATCATACGGCGGCTATGGCGGCGGCTACGGCGGATATGGTGCCGGTGGTTATGGC
GACTACTATGCCGGCGGCTACTATAATGGATATGACTACGGTTATGGTAAATACAACAAA
CAACAAAGTAGTGCTCAAAACAATTATTACAATAACAACACGTCGAGTAATTACCATCAA
AACAAGAACAATAGCAACAACTATCAGCAGTTCTAAGTAGAGCCTCAGCCGCATAGAGCT
GGCCTGGCCAGCAACAAAATCAGAAAGAAATAATCAAACAAAGCAAACAACAACAACCGC
AGAATATAAAAACCTTCTAATTTTTGCCATAGACCTGATCTGATCCAAAATTTCCACGTT
GTTGTGTTTCCCATTCAAACAAAACTGAGAGAAAAACAAAAACAAAAAGTTTAGCTGCAT
TTCGATATATAGTACCATATATATATATATATATATATTTATATATGCTTATATACCGCA
TGCATTGTCTATATGCATATTTGCATATAAATCATGTTGGTATATGATGTCAATGAACAA
CAACATCAAAAACAACAACAAGAACAAGAACAACTACGAAAGCAACGTCGCTAAAAACAA
GAAAACTTTTAAAAATTGTAGATTTGAAAGAGAGAAAACAAGAAACATTTCTTTAATGCT
AACATATAAATTTTAATCTAATCGTTCATTTTATATTGAAAAAAATGTGTATTTTGACAG
ACAATTTTCATCATTTAATAATAACAAGCAAAATCGCAATTTTTATATACACATTTATAT
CTATCTTATTAAATATAAACCTACGTATAATTTTAAAGGCATATAATTGATGTTTAAAAT
TTTAAAGCGTACCTTTTAAACGAGAATTCATTTAAACGAAACATTTAATTACCAATTATT
AGTTGAGTAGCATTTAAACATAAAACTGACGAAGCGTGTGTAAAAAAAAAGATGTGTTGT
TAATAGAGTGAGAAGGAGCGATGAGAAAAGTAGACGTGACGTTCAAGTCGAGGCATATAT
AATGCTACCATCCTGCCATTTATATGCGACCACCACCAGACCGGACCAACCAACAAACAA
CAACAACAACCAGAACAACATCAACAACAACTTGGTTGCCTTCAACAGACTTTCCAAAGA
TGACAAATACCTCAAACGCAAGGGCAGCAAACAAACAACCAGAAGAACAGAAAGAAACCC
CAGACATAACAACAAACAAAGAAACATGAAACACAAGAGAGGAGCATGTGCCAATTATGT
GAAACTGTGTGAAACGCCAGTGTTTTTGGCCTTTTGCGCAATTGCAACTTGTGCCTTTTT
TTAATTGTTAACTAAACTGTTATTGTTTGAACACACTGAAATCAAAATCTGTTGAAACAC
ACAAACACCCACACTACACACACACACCCACTTTCCCGCCAGCAATCCCATAAAATAGTT
ATTTAAATAGTTTCACCTTTTGTTTTGTTTAACAAAACACTAAACAACAAGCAACCAGAA
CAGAAACGACAACAAACAAACAAAAAACAAAACACACGAAACGCGTAATCAAAGCTTTGA
TTCAATGTCTATTTAAATATATATATACCTTATATATAGCATATAAATATATTTTTAGAT
ACATATTATTATTCCGGCAACGGGATAATATTCACGTTCTTTGCAATGCATATGTTTTCG
TATGCACCATACGTCAATATACCTACCATATATATTTATATCAAATATATACAAATGTTA
TATATTTATACATAAAACGTAACATTTAACTATGGTACTATTTTTGATAGTATTATTTTA
AGGCAAATCCTTGTAAAAAACAACTACAATACGATAAGAGCACAACAACCAGAAGCTCTG
AAAAGATCTGAAGGCCCCGGGGGGTCCAAAAAAGTCAGTGCAGTGCATCCGGGATATTAT
CATTCCGGTGGAACCACTGCTGCAGCACCCCCCCGCAGCCTCATTCGTTAGATCGTTCTT
TTATTTGCTTTATTTGCATTTCCGCTGCACTTTCTTGACCAAAACGTAACGTAATGTCCG
AAGCAATCCATTTTTGAGGCTTGTCTTCAGTTGCACCGCTAGCGCATTGCGGCATTCTGC
ATGTTCATACGTTGATTCCAGGATAAAAAACCACAAACAAACAACTAACTAACTTACTGA
ACAACGACAAGTAATTACAACTGCAATAGCAACATCAACAACATCTTAATTGTAGCAGTA
CAAAAATGCAACTTTTCCAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAACGATTC
ATAAAAACACACTTCGTCAATTTTAGTAATTTTAATTCAAGCATATATACATATATAATT
TTTTCTTATGGTTTCACATACACAAGCATTGCTAATCGCAAATGTATATATAAATACCTC
TTATAATTCGTATATCTTTGAATTTGAAATTTAGCAGAACCTTGAAATGAACTTTTTGCT
AATAATTATCCTATCAAATGTTGTCAATGTGCGTCGACAATTTGACTGTATACCAATTAT
ATATACATTTGTACATTTACATACACCTTTAATCATAAACTTTGAGTAAATTGTTTTACA
AAGAAATTGCATGTTTCTCAATGTTTTTAGCAAGTTGTCTGTATACAAAGAAAACCAAAC
AAAAAAATCTAGGCAAGATAAGAAAAAAATTTATTGACATTTATATTAAAGTTATCCCAG
AAAGAAAAGTTTTTATATAAATTTTATGCTATATTTTTATTAATTAATATACCGATTATT
ATGATGTTTAAATGTGTAAACAAATTTTTTTGATATAAACAAAATTTTTGTATACCTTTA
CATATACTTACCATACAATTATAGCAATAATTTTGTGCCCCCACTTTATATTAAAACCCT
AATAACAATATATTCTTAGACTTTATAATTTCCTATTCCGTTACTACTCTACAACTACAA
CTTGAAATTCTAAAACTAACCAACCAGACCACAAAAATAAAAGTGCGGGGAGCTGTAGCT
TAAGCACCGAGTTAGATCTGTTGAATAAATTAATGCCAAGTACGCAGATCGGGTGTTTCG
GTTCCCACTCCCCGCATTTGTACCCGTTAATTATGTAATATTACTTTCGTAACTATGATT
TTTGAACATATTTATATACGATTATATGATTGTAAAACCGAATTTTCCGATGTTTCGCCT
CACAAAAACGAAAAAAAAAAGAAATCAAACTAAACGAACCCAAAACATAAGTAAAAGAAA
CCCCAATGAGAGTTCAACTCAAAACACAGCCACCAACCACCCAAAAGCGAATATCCAAAA
ACGATCGCAAGCTGCGCGCCTTTGTCTTGTCCAAGCTTCTCGCAAGCGGTTAACCGATTG
CCCGGCCGACCCGGTAACCGATACAACCGGTGACCGAGGGTCCTTGGTGAGAACAACACC
AGTAGAGCCACTATATCCATCTACTATCCACCGACATCCGAACAAAGCAATCAATCAGGC
AATCAAGCAACCAAGCGACCAGAGATCGAGCAATCGAGCGATCCGCCATGCAAAACCGCA
CCAACAGTGTTAACTTTTCACTTAACTGTAACGTTTTTCATTTTTTACTTAAATCTTCCT
TTTTCTATTACATTTAAAACGTATATATTTACAAGTAACTTAGCGTAATTAATATTTGTT
TTTAGTAAAATGCATTGAAAAACTCTAAAAAAAAAAGAAGAAAGATGAAATGATAATATA
ATGGAACCACTAAAGTAATGAATGAATTAAAATATTGTCATACCGATTCTGAGACAACTC
TTAAGCTACAAATCCAGTTTTCTTGTTTTTAACAACAGCTACAACAACAACAGAAATGAA
CACGAAGAGTAATTATTATAATCATTATATTAACTCGAGAGTATAAAGTAAAATTTGTTG
ACTATTTGCATTTGTTTTTGTTTTTCGCAAAACGTTTTCTATGACACGCAAAATAATAAT
ATATTCGCGACAGACCACTCCGCATCCTCATCCCCCTTCCCTTCCCCCTTGACCAGCCTT
GTAATTCCCGAAGATCCTTCAATGGGAGTGATATAAAAGAAAATTCACGAAAAATTCAAA
ATGATCATTTTATTACTTTTTGCTGAGGTGAGACATTCAAAATACACACACACAAGAGCA
GCAAATGAATTCACAAATTTTTTTGGCAAAAACCTTACAAAATTATTTACCGAATATTTT
CAATCGAACGTTTACAAAGTAATTAATTTGAAATTGAAATGCTGAAATTGTTGTGTGGAA
AATGAGGTAAAAATTAAAAAACATAAATGCATAACGAGTGCTGTAAGGAAATGAGAAATC
GAATGAATTGAAATATCCATTGCAATACATTGTGAAACATGTTAATAAGTCGAGTCGCGT
CCGGTCGACAACTAACCAAAATCTGAGACAACAACCAGAGTTATATTATATAATTATATA
TAACGAAGCGAAATAACAACCACCAATCCAATCGAGAACCGCATGTATGTGTGAGCGCCG
CCTTGCGCCATTTTCCTCGACATTTGCAAGAGGAAAGCGAGTGAAAATTGTTTTTTAAAT
TTTTATTGTGTACCAGCAACCAACAGCTACAACAATCGACAACTACACATGTTAGAGCAA
CATTTTAACCATCAATCTTATAATCAAAATCCACAAACAAGAAAAATGAGCAAATAAAAG
AAAAACGaaaaaaaaaaaaaacaaaccagacaacaattttgtgtgtatttcagtttccgc
ccacaacccacccctgatctctcacccaacaccaaccacaatctcctccggatccggagc
aggtgattcctttccagctcgctcgcggtatgtgccatttgaattgtctcccctcggctc
gtcggcgtcgtccaaaactgggcggcacaaattttgaccaagcgaaaaagtaaaagaata
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agtagttggcagtaccaattagacccatcttattttagttcgtgtcgttttacaccattt
tataagataagctttgtttgtgttttcatcaattttctgtacgacccaatctgcgcatgc
tgtgtgtgtgattgattgcaccacgaaatgccattgcaaccaaaagACGGCTACGGTTAC
GGCGGCGGCTTTGAGGGTAACGGCTACGGCGGAGGCGGTGGTGGCAATATGGGCGGCGGT
CGCGGTGGACCCCGCGGCGGCGGCGGCCCCAAAGgtattaacactaagaagcgcctagca
aaaaaaaaaataaaataactatctgtaaccaacgaactgttgggccctcattcctcctat
taaaaaaaatacatagtgtagtctctactattcgcaatgattttaattatgtttgtaaag
cagtttcatcgtttttggtttatatccttcctccattggcttttcatgacttatgtttta
ctttattttgctatgctgtgctgcccccccactagaattggtcaaaattttcaaaaaaat
aacaaaaaatgaaaaccgaagtcgtttggcgtagttaatgatatctatagatgaacccct
ctcctttcctacccgcagatgttgagcatgtctttctttttgcctgatttaatctgatac
tctcgattcgaatttaactgactaatgccttgcacactttccaaacgtttccacaacagG
CGGTGGCGGTTTTAACGGTGGCAAGCAGCGCGGAGGCGGTGGACGCCAGCAGCGGCATCA
GCCCTACTAAAAAGTGGGCAGGGGGCGTGGGCATTGGGTATCTCGCATTCTCCGGATAAC
TGCAAACTATTTGAATTTTACCTAGTTTAGTTTGTTATGgtgagttaaaagccatcgacg
ctttgttgccagttcattaaagttgattatatcattgcagCATTACTACAAGAAGCAACA
CACATCTCTGCAACAACACCATCTGGGTAACCGCATATATACATACGCCGTTGTATATAT
CTGTATGAAAGAAATGAGGAAAAAAGGAAATGAATAGACTGGCTGGCTGGGAGCAATAAT
ATCAACATCAGCAACCTTAACACACCTTTACACACTTGATGTGTAGCACCATTCCAACAA
CAGCATCATACGCAGCTAAAAAACATCATTTATACAATACAAGGCAAACCACAAAGCAAA
ACAAGAAAAAAAAAAAACAACACAAATAGATACACACACATAGTTAGGCATACACATGTA
ATTTTTCAGCAAGTGGCTAATTTTTCATAGCCACACGCTCATTAAGCCGACAAACCAACC
AACCAAACAACCAACCAACCGCCCACCAAACAACCCTTCAACCCGTGCAAAACCACAAGA
CAACATTGCAGGGAAACGTGGCAAACAACATTTGCCAAACTAACTGCTGTGCAATGCTCA
CGTTGTCTGTGTGTCGAAACTAATTTGTTTTTCTAATGTAGTCCCATACATTATGCGAGG
TAATTGTTTAACGCGTCAGTAGAGCACAGGATGTCGGAGAGATAGGAAAGATAGGAAAAA
AAAACAGAAGAAATCAAACAAAAATACTTACAAAACAAAACAAAAAATACAGCTAAAATG
TTTCATATATTACACAATACAATAGAGTATAAGTATTTGTTTAACTTTAATTATGAATTA
ACTGTAATATGTAATAATAATTATAGAACCAACAAACAAAAGAAGCAAGCATTGACTGGC
TGGCACATCGGGTTGCCTTCTTCCCGTTCGATTGAGAAAAACTATATACGATATTCGATA
TACGATATACGACAAGACACAGGACAAGACAACAAAGCAGAAACAACCTACAACAAACAA
ACCACCATATTACATAATATACTAGTACAGAGCAGAGAAAGCGGAAACGATATTAGTTTT
TGTTTTCCGGATATGTGTATTACGCTCATAGACTACATATATACATACATAATACATAAT
ACATCTATATTTATGTACACTTCTGAAAGGGAAGAGATTTATATTTTAATAAAAATCTAA
AGTCACACTCTCTACGTACACACCCACAATTGTATAGACCACTGCAAGAATGCGAATTGT
TAAATCAAATCTATCTATGTATACACTACTATAGCTATATGAAAATCTTTATGAAATCGT
CCGACCGTCAAGCTGAATGGATGGCATTAATATATGTAAATGCCGATGTGTGCTGGACGG
GCAGTTTAGGTAGCATTTCGAGGAAATCAATACATGGAAGCGTGGATTTTCCCCCTTAAA
AAAAAAAAGAAATTAAACATTCTCAAGCGAAATTACAACCTAACTTAATTGAATGATAGG
AGATCAGTTTTAAAGCGAACATTACATTAAAGAAACCTAAATT