FB2026_02 , released June 18, 2026
Transcript: Dmel\PlexA-RF
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General Information
Symbol
Dmel\PlexA-RF
Species
D. melanogaster
Annotation Symbol
CG11081-RF
FlyBase ID
FBtr0309865
Feature type
Associated gene
Evidence Rank
Length (nt)
10243
Evidence Score
Genomic Location
Genomic Maps
cDNA Clones Consistent with the Transcript ( 193 )
cDNA Clones, Fully Sequenced
Exact Match
    Contained within the annotated transcript, internally consistent
      End(s) extend beyond the annotated transcript, internally consistent
      cDNA Clones, End Sequence Only (ESTs)
      Contained within the annotated transcript, internally consistent
      End(s) extend beyond the annotated transcript, internally consistent
      Sequence
      CTTATAGTATCGATAACATTTACATACAATGATGTGTAAATTAAAGTGTGGTGTAATTCGAAAATAGACAGAAATTATGT
      TCAGTGACTTGCGATGTAAAGAAATAATAGTTAATGAGTGAAATATAGGAAAACAAACAGTAAGCCGGATTTCCGATTGT
      TCACTAGAAAACTATCGCCGTTCCATAATTCAGATATACATACAAAATTGTCATTTTTTGCTAAATATTAAAAAAAGTGT
      AATAAAATCATTTAACGTTCCAGTGTATATTGCATTGCTTTAGAATTATTAAGAAAATACAAATTTTCTTTAACTGGTAT
      ACAACGTTGTATGTTTACATGATGGTCATACAAGTTATTGCTCCAAGTTAAATTATCTTGAATGGAACGGATAATAAAAA
      TTGCAAGAATGACACCAACGCAAAGGAAATTTTAATATTTACGTAAAATTTCAAATAAATAAGGGACATACAAGCGCCTA
      CAAGTAACAATTTCATAAATAAGGTAGCTTTGATAGTCCTGTTTAAGGAGCGATTGTGGAGATGAATTTTGTTCTTAGTG
      TGTTGTTAATAGCAATTCTTAAAGATAAGTATGATTACTGGCTGCCATCGAGGACAGGTTGTCAAACCCTGGCAGCAAAT
      ATATGGTCTGACAAGACGACTGCGCAAAATGAGCCGATAAATTTGACTAATGCAAATGCACCGATAAAGAATGCAAAGAA
      TCTGAATTCTACGATTACAAATGTAGCTGCGTTTGACACCAAATTGAATCACCTATTAGTGGACACCATTACTGGACGAG
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      AATGATTCCGTCGAGTGTAGCATTCTTGATTGTCCATTAAATGCAGTTCGCAGTCCGACGGACAATTATAATAAGGTCTT
      GCTCATTGATCGTGCAACTTCAAGACTTATTGCGTGTGGATCACTATTTCAAGGTACATGCACAGTTCGTAATCTTCAAA
      ATGTCAGCATAATTGAGCATGAAGTTCCTGATGCTGTTGTGGCTAATGATGCCAACTCCTCAACCGTAGCATTTATTGCG
      CCGGGACCTCCACAACATCCGGTGACTAATGTGATGTACGTCGGAGTTACATACACAAATAATTCACCGTACCGCAGTGA
      AATTCCCGCAGTTGCATCCCGCTCCCTCGAAAAGACTAAAATGTTTCAGATTGCTTCCTCGGCAGTTACAACTGGAACGA
      GAACTTTTATAAACTCATACGCACGTGAAACATATTTTGTCAACTATGTTTATGGATTCAGTTCTGAGCGATTTTCTTAC
      TTTCTAACAACACAGTTAAAGCACAGTCACCATTCTTCTCCTAAAGAGTACATAACGAAACTCGTACGAATATGTCAGGA
      AGACTCGAACTATTATTCTTACACTGAAATTCCAGTGGAATGTATAAGTGATGCTCAAGGCGGCACTAAATTCAACTTGG
      TTCAGGCTGGATTCTTGGGAAAACCTAGCTCAGACCTGGCTCAAAGCTTAGGTATATCTATTCAAGATGATGTCCTCTTT
      GCTGTTTTTTCAAAAGGAGAAGGGAATACACCAACGAACAATTCTGCACTCTGCATTTACTCATTAAAATCTATTCGTCG
      AAAGTTTATGCAAAACATAAAATCCTGTTTTAACGGAAGTGGCATGAGGGGCCTGGACTTTATATCACCCAGCATGCCAT
      GTGTTCTAACGAAACTGCAAACCATTGGAGAGGACTTCTGTGGATTAGATGTAAACTCACCTTTAGGAGGAGAAACCCCC
      ATTACTTCAGTACCGGTGGCCATGTTTAACACAAAGTTAACTTCTGTTGCTGCTACGAGTACAAGCGGGTATACCGTTGT
      CTTCGTGGGGACTAGCGATGGATTTCTTAAGAAAGTTGTAATCGAGTCTTCATCTATTGCCAACGAGTATGCTAGTTTTG
      CAGTAGATTTAGGGTCTGAAATTAATCGGGATATGCAGTTTGACAACCAAAACCTTTATATATATGTTATGTCCAAAACA
      AAAGTATCCAAGGTTAAAGTATTTGATTGCTCTGATTACAAGACATGTGGAGATTGCTTAGGTGCTAGAGATCCATATTG
      TGGCTGGTGCTCATTGGAAAATAAATGTAGCCCACGCTCCAACTGCCAAGACGACGCAAACGATCCTCTCTATTGGGTTA
      GCTATAAAACAGGGAAATGTACAACAATAACAAGTGTTGTGCCACACCAGCTACAACGTACTACAGCTCGAACCTTAGAG
      CTAATCATAGATCATTTGCCTCAGCTGAAAGAGAATTTAATATGTGCTTTTACTACAGAGGATAAAGCCCTTTTCACTAA
      TGCTACAAAAAAACGAAATGGCGTAAACTGCACGACACCACGAACGGATATGCTACCCCAAATTGAACAAGGGAAACATC
      ACTTTACTGCCAAACTATCTGTTCGCACCAGAAATGGACCCGACTTAGTGTCCACGGATTTTACTTTCTTTGATTGCAGT
      ACGCACTCTTCTTGTACACGTTGTGTGTCCTCGGAGTTTCCATGTGATTGGTGTGTTGAAGCTCACAGGTGCACACACGA
      CACAGCTGAAAACTGCCGGAACGATATTTTGGTAACAGGTGTTAGCCGGATAGGTCCTAGTTACAGATCAGGTCCCGGAT
      TTTGTCCAACGATCAACGCTACAGGTGATGGAAGTGAAGTACTTGTCGCTGGTGGTACAAGCAAATCCATTAAAGTAAAA
      GTTCATATTATTGGGCAATTTATAGTTCAAACGCGGTTTGTTTGTCAATTTAATATTGAGGGACGTGTAACTAGTTTAAA
      CGCTCAGTTGTTGGGTGACACCATTTACTGCGATAGCATGGAATTTCAGTATACTTCTAGATCGCCCAATTTGACAGCAA
      CTTTCGCTGTAATATGGGGCGGGTCGAAGCCACTTGACAATCCTCATAATATACATGTTGTTATATATCGATGTCGAGAA
      ATGGCCGACAGCTGTGGTATATGCTTGGCCCTATCTGAAAAGTACAATTGCGGATGGTGCTCGTCTACTAATACATGCGA
      AGTTGAAGAACAATGTAATAAAAACAAAGAGGGGAAAACTGATTGGTTAAATCGAAGTGAAATTTGCCCAAACCCTGAAA
      TTCATACATTCCAACCAAAAACAGGTCCCTGGGAAGGAGGAACAAATATAACAATACGAGGAATTAATTTAGGCAAAAAC
      TATAACGATATTTATTCAGGAGTTCGAATAGCTGGTATAAATTGTATGCCGTTTCCTCAATTTTATATTGACACTAAGCA
      AATAGTATGTACCGTGGATAGTCCTGGAGAACAGATGTATAGAAATGGCAAAATAGTGGTACAAATTGGGGACTACCGTG
      GTGAGTCCAAAGAGGACTACGAGTTCGTTGACCCGAAAATTTTGGATTTTAATCCAAAGTTTGGTCCAACTTCAGGTGGA
      ACCGAAATACATATAACTGGAAAGCACTTAAATGCCGGCTCTCGTATACAGGCATCCATAAACGATCACTTACCGTGTAA
      AATACTAAGCACAGATTCTTCTCAAGCAATATGTCGCACTTCTGCTTCCCCTGGTATTATTGAAGGAAGACTAAAAATGT
      CTTTTGATAATGGGCCCCGAGAGTTTAATGACTACAATTTTAAATATGTACTGGATCCTACAGTTGAACACGTTAGTTCT
      GGACCAAGCGGGCAAATAAAAGTTCCAAAAGGAATACCAGCAGGCGGTATACGAATTTCTGTAACGGGTACCCAATTTAC
      CAGTATACAAAATCCCAATATTTATGTAGTGTATAATGGAGAGATGTATGCAAGCCCATGTCGGGTGCAATCGGATACGG
      AAATGGAATGTGCATCTCCAGTTGTTGATGTGGACAGCCATGTTATTGAAGCGGAAAGGCCAATTCTTCTTGAATATGGG
      TTCCTAATGGACAATGTTTTGCGTGTTCAAAATTTATCTAAGGTTCATAACAACCATTTCGAGCTTTACCCAAATCCAGA
      GTATTTTATATTCGAAGAAAGAGTTAAGTACTTTAAGAGTGAATACTTAACCATAAATGGCCGAAATTTGGATCGCGCTT
      GCAAAGAAAGTGATGTAGAAGTAAAGATAGGAAATGGATTTTGCAATATTACATCACTTTCAAGACAACAACTAACATGT
      AGACCTCCTTCTGAAGCAACAGCAACCAAAAGCATGAATGGACCTGAAGTAATTGTTCGTATTGGAACTTCGCTAGAGTA
      TCGTATCGGTATACTTAGCTACGAATCGTCTAACATCATTTTGGATTGGGGAGAAAATGTAATTTTTGCTGTAATAGCCA
      CAATTGTTATCTTGCTGCTGATTTTTGTTGCTTTGCTTGTGGCTTATAAAAAGAAAAGTTCGGAATCGAGCCGAGTTCTT
      CGAAACATGCAGGAGCAGATGGACATTCTGGAGCTACGAGTCGCAGCTGAATGTAAAGAGGCCTTTGCCGAACTCCAAAC
      TGAAATGACTGATCTCACAGGCGATCTTACTTCTGGAGGCATTCCATTTTTGGATTACCGGTCATATGCAATGAAGATTC
      TATTTCCAAACCATGAAGACCACATTGTACTACAATGGGAACGTCCTGAGCTTCTTCGGAAAGAAAAAGGCTTACGTATT
      TTTGGCCAACTAATCATGAATAAAACTTTCCTCCTGCTTTTTATACGAACCCTGGAGTCCAACCGATACTTCTCAATGCG
      AGAACGAGTTAATGTGGCCTCCTTAATAATGGTCACTCTGCAATCTAAACTAGAATATTGCACAGATATATTAAAAACTT
      TATTGGGAGACTTGATCGAAAAATGTATAGAAGGAAAGAGTCATCCAAAGCTCTTACTACGACGAACTGAAAGTGTGGCA
      GAAAAAATGTTAAGTGCTTGGTTTACATTCCTTCTTTACAAGTTTTTGAAGGAATGTGCTGGCGAGCCTTTATATATGCT
      TTTCCGAGCTGTGAAAGGACAAGTAGACAAGGGTCCTGTTGACGCTTGTACACATGAGGCAAGATACTCCCTTAGTGAGG
      AAAAACTTATACGACAGTCTATTGATTTTCGACCAATGAACGTTTATGCAAGCATTATACAGCAGCCAATATTTTGCAAT
      AACTTAGATATGTTACCTTCTCACACCGAAAATGTATCTGTTAAAGTATTGGATTGCGACACAATTGGACAAGTGAAAGA
      AAAATGCTTGGAAACCATTTATAGAAACATTCCATCAAGCCAAAGACCTCGAAAGGATGACTTAGATTTAGAGTGGAGAA
      CAGGCGCTACTGGGCGAGTAATTCTGTACGATGAGGACGTAACATCAAAAACGGAGAGCGAATGGAAAAAGCTCAACACT
      TTGCAGCACTATAATGTTCCGGATGGAGCCGGGCTAAGCTTAGTACCAAAGCAAAGTTCCATTTATAACTTCAGTATTTT
      ATCGGACAAAAATGAAAAATCGCACAACCGCGCAGGAAGTCCTCTTAACAATGATATGCATGAAAATGGTCTGAGATACT
      GGCATCTAGTAAAACATCATGATAGTGATATGCAAAAAGAAGGGGAACGGGTTAACAAATTAGTGTCAGAGATTTACTTA
      ACCAGGCTATTGGCTACTAAAGGAACGCTTCAGAAATTTGTAGATGATCTCTTTGAAACGATATTTAGCACCGCTCACCG
      TGGATCGGCACTTCCATTAGCTATAAAGTACATGTTTGATTTTCTTGACGATCAAGCTCAATTGCACGGTATTACTGATC
      CAGAAGTTGTGCATACTTGGAAAAGTAACAGCTTACCATTGAGGTTTTGGGTGAACTTAATTAAAAATCCAAATTTTGTC
      TTTGACATCCATAAATCGAACATAGTGGATTCCTGCCTGTCAGTAGTAGCTCAAACTTTTATGGATTCTTGTTCGACTTC
      TGATCATCGATTGGGCAAAGACTCACCAAGCTCGAAACTTCTGTATGCAAAAGATATACCAGAGTATCGAAAATGGGTAG
      ATCGCTATTATAGAGACATTCGGGATATGTCCCCCATTTCAGATCAGGACATGAACGCCATGCTTGCGGAAGAGTCAAGG
      CTGCACACAACAGAATTTAATACGAATTGTGCTTTACATGAGCTATACACATACGCTGTGAAGTACAATGAACAACTAAC
      TGTTACACTTGAAGAGGATGAATTTTCGCAAAAGCAGCGATTGGCTTTTAAATTAGAGCAAGTTCACAACATAATGTCGT
      CAGAATAAGAGCTGCGCCATCCTACCAAGATGACAACAAAATACTAAAAGTTCAACATTATGAAAATCATTTGTATATGT
      CGTATTTGCTCATTAATTACTTAATAGTATGTTATTGTATGTATGTATGTATTTAATTTAAGTAAACTCATGTAAGATCT
      AATATGCAAGACAAGTAATCTAACTAAAAAAATCGACTGACTTTTATTTAAACTAAAAATGAACTAATTGGTTTATATTT
      ATATCCTTTCTTACCCATATTGAAGATAAAAACTATTTTGGCATTCTTAAAAATACAAAGCTATCAAATGTAAATTTTAA
      CAATTTTATTCGTCACAAAATGTGAAAGCGAAAAAATTTTAAAGCATATGGCCACATTTATTAAAAATAAATAATTTATT
      AATTATATTCTTCCAATTATTTATGCGTTATGATATTTATACAAAAATAATACTGATTTATATGTCTTATATTTTTATAG
      TTTTCTTTTTCCCGAGCAAGGAGTATAAGTTGTTAAAAACTTAAAATACCGACGCTTAAATAGTTACCCTTATATAACTT
      ATTTAAAGAACTTATGTGGGTCGCAGGGGTGTTCCGGTTTATAATGACAAAAAAGCTTTTTTTGCAAATCTTCACGTTAT
      ATATGGATGTTAAGGGCAATTAAAAAAATATTTTGTTTAAAAATATGTACTTTAATTTACATAATTTACAAACAAAGTGT
      TTTGCTGTAATCATAACAATATAGAACGAAAATCACGAAGACTTTCGATTTTTTGTAACTTGTTTAAAAATATTTCTTTT
      GGACCTTGGAAGTCAAATATTGAATTATGGGACAAAATGTGTCCTTTTTAGTTAATTATTACTAATCAAAAAACATGCAA
      ATGACTTGCGAACCTTCGAAAATCTGTTAAATATTTGTGTAACAATTTTCCAATACAATTGCATTCGTGGCTTTGACGAC
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      ATATATTTTTACAGATATAATAATACAGAATAATACAGATAATAGAACACAATTAATTCTTTGCTCTACGACAGTCGCAC
      AAAATTTGGAAATAAAAAATGCGACTATTGGAAATAAACTTTAAACGTATCCAAATATAATTAAACATCTTATGGTAATC
      CAAATGAAATAAATTAAATCATTTTAAATAACCGCTTTACAAGTTAAATGATACAAATTTATTTGTAATTACTTTTATTT
      ACATCGAATTATTTGTTTGTTATTCAAAGTTTGGATGAATATACAATATTAGTTTATGCTGTTATATAAGGTATGATTTA
      TTATCTTATAACATTATCTTACAAAAAGTTTTCGTTATGCTAGTTGTTTTTAAAATTAAAAAATTTAATTTGGTGACATT
      TCAAAATAACCATGTTTCAACTGTTTTGAATCATTAACAAAAGTCGATTAAAAGTCAAAAATGCTATATTTTTTTGATTC
      AACATTTCATCTGGTCAATTTATTGCTACTACGCAAATATACTTAAAATTAGAAAATATACCTGTAGCACGTAATGTATA
      AGAATATATTTTTCATGTATCTGTGTATGTATGTAAAAATTAATAATTAAAAGTGTACATATTTATTGAATTGAGAAATG
      GGTTGATGACCGATGACTCGGATCTATAATGAAAAACATTAATTTGTACCAACATAAATTGAAAGCAAACGTAAATTCCA
      AACTCAAATTAAATATTCTGATATGCACAAAAAAAATTCCCACCAAATCGATATCCCAATTAAGTAAACAAAACTGAACT
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      CTG
      
      Other Products of this Gene
      Other Transcripts
      Name
      FlyBase ID
      Length (nt)
      FBtr0089223
      6592
      FBtr0089225
      5153
      FBtr0089224
      5200
      Polypeptides
      Derived from THIS transcript
      Name
      FlyBase ID
      Length (aa)
      FBpp0301599
      1928
      Derived from OTHER transcripts
      Name
      FlyBase ID
      Length (aa)
      FBpp0088287
      1945
      FBpp0088289
      1505
      FBpp0088288
      1505
      Comments

      Transcript terminates at site supported by polyadenylated cDNA.

      Transcript postulated to overlap transposable element.

      External Crossreferences and Linkouts ( 1 )
      Crossreferences
      RefSeq - A comprehensive, integrated, non-redundant, well-annotated set of reference sequences including genomic, transcript, and protein.
      Synonyms and Secondary IDs (2)
      Reported As
      Symbol Synonym
      PlexA-RF
      plexA-RF
      Secondary FlyBase IDs
        References (0)