FB2026_01 , released March 12, 2026
FB2026_01 , released March 12, 2026
Clone: Dmel\CH223-18M04
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General Information
Symbol
Dmel\CH223-18M04
Species
D. melanogaster
Name
CH223-18M04
FlyBase ID
FBcl0359935
Feature type
Computed gene(s)
 
Collection Status
N/A
Known Problems
none
FlyBase assessment
    Library
    CHORI-223_BAC
    • BAC genomic clone collection for D. melanogaster, iso-1 strain, adult, 48kb inserts.
    Strain
      Vector
      Tissue Source
      Stage
      Tissue/Position (including subcellular localization)
      Reference
      Sequence Data of the Insert
      Full Length Sequence
      Genomic Location
      4:1,164,436..1,200,662
      Total bases
      36,227
      NCBI
      Full Length sequence dataSequence Downloader
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      AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGTCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCGCACCCTTG
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      GTTCAACAATTTTACTGTTATATTACAAATTGTTATTATGTTTTAATTTAAAGTTATTAACAACAATGGTGGCTATATCA
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      AGATCGAGCACAAACAGTTATATGTTGACCGAAAGGTGTTTTAATAGCGCTTTAAAGCTGCACAGGTAATGAGTCCACAA
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      GCTAAACTATTAGGATGGGAAGAATCCCACTAGAAAGTCTGTCAGTGTATTTTTTCGCTATTTCACGTCTAATCCTGTCT
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      GAAAATGCTGTTGCTTTTTGTCAGTATCGCGGTGTTGCTTATGTTGCAATCAGCACATCTCTACGATCTAATCCAGTGAT
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      CTGGGTGGGTAAGTAACTGTTCCCTCTGAGGTCTGCAGCTGCACGCTCGCTACCTGCCGGTCGTTGGTTGAGATTGGGGG
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      Library Information (1)
      Library: CHORI-223_BAC
      Description

      A BAC library containing sheared genomic DNA fragments with average size of 48 kb.

      Sample preparation
      Protocol

      DNA was isolated from adult fly tissue, embedded in agarose blocks and sheared by four freeze/thaw cycles. Ends were polished by treatment with mung bean nuclease and T4 DNA polymerase, and cloned into the pTARBAC6 vector between the BstXI sites.

      Comment

      Though 17,992 clones were generated, sequences for only a few have been deposited at NCBI.

      Reported As
      Symbol Synonyms
      CHORI-223_BAC
      References (2)
      Research paper (1)
      Osoegawa et al., 2007, Genomics 89(2): 291--299
      BAC clones generated from sheared DNA. [FBrf0200134]
      Personal communication to FlyBase (1)
      Venken et al., 2012.4.25, Large retrofitted and site-specifically integrated duplications for the Bloomington Drosophila Stock Center collection.
      Large retrofitted and site-specifically integrated duplications for the Bloomington Drosophila Stock Center collection. [FBrf0218451]
      External Crossreferences and Linkouts ( 0 )
      Synonyms and Secondary IDs (0)
      Reported As
      Symbol Synonym
      Secondary FlyBase IDs
        References (0)